Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
21601	Cc1ccc(-c2ccc(C(=O)NCC3CCN(Cc4n[nH]c(-c5ccc(F)cc5)c4C)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	6FTP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21602	Cc1ccc(-c2ccc(-c3ccc(C(C)(C)CCC(=O)NS(=O)(=O)c4ccccc4)cc3)s2)cc1	AlphaDrug	6FTP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21603	CC(C(=O)NC1CCCCC1)c1cc2cc(Cl)ccc2n1Cc1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21604	CC(C)CC(NC(=O)c1ccc(-c2ccc(C(=O)O)cc2)cc1)C(=O)O	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21605	CC(C(=O)Nc1ccc(-c2cccc(C(=O)O)c2)cc1)c1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21606	CC(C(=O)NC1CCc2ccccc2C1)c1ccc2nc(-c3c(O)ccc(O)c3O)[nH]c2c1	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21607	CC(C(=O)NC1CCc2ccc(C(=O)O)cc21)c1cccc(C(=O)Nc2ccc(C(=O)O)cc2)c1	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21608	CC(C(=O)NC(=O)c1ccc(-c2cccc(C(=O)O)c2)cc1)c1cccc(Cl)c1	AlphaDrug	3WHA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21609	Nc1nc(Cl)nc(-c2ccc(S(=O)(=O)NC3CCCC(NC(=O)c4ccccc4)CC3)cc2)n1	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21610	CC(C(=O)NCC1CCCCCC1)c1ccc(C(=O)Nc2ccc(C(=O)O)cc2)cc1	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21611	CC(CCC1(C)c2c(Cc3ccc(C(=O)O)cc3)cccc2CN1C(=O)C(C)C(=N)N)C(=O)O	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21612	CC(C)C(=O)Nc1nc2ccc(Cl)cc2n1CCCCC(=O)NC1CCCC(CC(=O)O)C1O	AlphaDrug	3WHA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21613	CC1(Cc2ccc(OC(F)F)c(C(F)(F)F)c2)/C=C(OP(C)(=O)O)\C=C/C=C(/c2ccc(Cl)cc2)C1	AlphaDrug	5EGU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21614	CN(C)CCC(Cc1ccc(CC(=O)O)c(CCC2CCCCC2)c1)c1ccc(-c2ccc(C(=O)O)cc2)cc1	AlphaDrug	5EGU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21615	CC1(CC2=C/C=C(/c3ccccc3)OC(c3ccc(F)cc3)/C=C\2)/C=C(OP(C)(=O)O)\C=C/C=C(/c2ccccc2)C1	AlphaDrug	5EGU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

21601 to 21615 of 73725 items. Total 4915 pages.