Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
21631	CC1(C)CC(=O)N(Cc2ccc(-c3ccc4nc(N)oc4c3)cc2)C1O	AlphaDrug	6NU1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21632	CC1(C)CC(=O)N(Cc2cccc(-c3nnc(N)s3)c2)c2ccccc21	AlphaDrug	6NU1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21633	CN(Cc1ccc(-c2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1)C(=O)Nc1ccc(C(C)(C)C)cc1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21634	CC(c1ccc(-c2ccc(C(=O)N3CCC(C(=O)O)CC3)cc2)cc1)N(C)C(=O)c1ccc(C(=O)O)cc1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21635	Nc1ccc(-c2ccc(-c3nc(C(=O)NCc4cccc(C(F)(F)F)c4)cnc3N)cc2)cc1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21636	CC(C)(CCc1ccc(-c2cc(F)cc(F)c2)cc1)NC(=O)c1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21637	CC(CN1CCC(c2ccc(C(=O)O)cc2)CC1)c1ccc(-c2ccc(C(=O)O)cc2)cc1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21638	NCCC1CCCN(c2ccc(-c3nc(Nc4ccc(C(F)(F)F)cc4)ccc3Cl)cc2)C1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21639	C/C1=C(\C)c2cc(-c3ccc(C(=O)N4CCCC(c5ccccc5)C4)cc3)ccc2C(=O)NC(C)C1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21640	CC(C)(C)c1ccc(N2CCN(C(=O)CCc3ccc(-c4ccc(F)cc4)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21641	CC(C)(C)c1cc(-c2cc(F)cc(NS(=O)(=O)c3ccc(-c4ccc(F)cc4)cc3)c2)ccc1O	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21642	CC(NC(=O)C1NC(=O)C(CO)NC(=O)C(CC(C)(C)C)NC(=O)C(C(C)O)C1O)c1ccc(-c2ccccc2)cc1	AlphaDrug	5OSE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21643	Cc1cc(-c2nc3cc(C4(N(C)C(=O)C(N)=O)CC4)cc(OCCCCO)c3[nH]2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21644	Cc1cc(-c2nc3cc(C4CCCCC4)cc(NS(=O)(=O)Cc4ccccc4)c3[nH]2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21645	Cc1ccc([SH](=O)(Nc2ccc(C3CC3)cc2)c2ccc(Cl)cc2)cc1	AlphaDrug	4RLU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

21631 to 21645 of 73725 items. Total 4915 pages.