Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14416	CC12OC(CO)C(O)C(O1)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)NS4(=O)=O	AlphaDrug	6G5L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14417	O=C(c1ccc(Cl)cc1Cl)N(Cc1cccc(-c2ccccc2)c1)CC1OC(CO)C(O)C1O	AlphaDrug	6G5L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14418	COc1ccc(-c2cnn3c(C4CCN(C(=O)c5cccc(-c6ccc(F)cc6)c5)CC4)cnc(N)c23)cc1-c1cccc(O)c1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14419	COc1ccc(-c2cnn3c(C4CCN(C(=O)c5cccc(C#N)c5)CC4)cnc(N)c23)cc1-c1cccc(O)c1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14420	COc1ccc(-c2cncn3c(-c4cccc(C)c4)cnc23)cc1-c1ccccc1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14421	COc1cccc(C(=O)N2CCC(c3cnc(N)c4c(-c5ccc(OC)c(-c6cccc(O)c6)c5)cnn34)CC2)c1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14422	COc1ccc(-c2cnn3c4c(c(CCCCCC(=O)NCCCN)c3c2)CCC4)cc1-c1cccc(O)c1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14423	COc1ccc2cc(-c3ccc(-c4ccc(C(C)(C)C)cc4)cc3)ccc2c1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14424	CC1=C/C=C(/c2cc(F)c(O)c(O)c2O)Oc2cc(c(Cl)c3cc(-c4cccc(C(=O)O)c4)ccc23)/C=C\1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14425	COc1ccc(-c2cnn3c(Cc4ccc(Cl)cc4)cnc(C)c23)cc1-c1cccc(O)c1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14426	COc1ccc(-c2cnn3c(C4CCN(C(=O)C(C)NC(=O)c5cccc(-c6ccccc6)c5)CC4)cnc(N)c23)cc1-c1cccc(O)c1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14427	COc1ccc(-c2cccc(O)c2)cc1-c1cccc(O)c1	AlphaDrug	5EXN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14428	O=C(O)c1cn(C2CCN(Cc3ccc(-c4nnn[nH]4)cc3)C2)c2ccccc12	AlphaDrug	5NK7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14429	O=C(NC1CCCCC1)c1cc(NCCCO)c2nc(NC3CC=CCCC3)ncc2c1	AlphaDrug	5NK7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14430	O=C(Nc1ccc(Cc2ccccc2)cc1)Nc1ccc(-c2ccc(C3CC3)cc2)nc1	AlphaDrug	5NK7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14416 to 14430 of 73725 items. Total 4915 pages.