Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
57901	CC(O)C(NC(=O)c1ccc(C(N)O)cc1)C1CO1	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57902	O=C(NC1(CO)OC1CO)c1ccc(C2CNNC2)cc1	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57903	CCNc1cc(C2CCN(O)C(O)C(=O)NC2=O)cc(C)c1F	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57904	CC(=O)NC(=O)[C@H](C=Cc1ccccc1)CCCCN[C@H]1CO1	SBDD	3HY9	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57905	CCCC(=O)NC(=O)c1ccc(OC)cc1	SBDD	3HY9	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57906	CCC(CO)NC(=O)c1ccc(C(N)=O)cc1	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57907	COC1NCCC(c2cc(C)cc(NC(C)C)c2)C(=O)NC1=O	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57908	NC(O)c1ccc(C(=O)NC2CCCC2)cc1	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57909	COc1ccc(C(=O)NC2CCC(N)C2OC)cc1	SBDD	3HY9	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57910	COc1ccc(OC)c(C2OC2C(NO)C(O)C2CCCN2)c1	SBDD	3HY9	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57911	CCCCC(=O)NC(=O)c1ccc(C(N)=O)cc1	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57912	CCC(O)NC(O)c1ccccc1O	SBDD	3HY9	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57913	NCCc1ccc(C(=O)NC(CO)CO)cc1	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57914	NC(O)C(CCNC(=O)O)c1ccccc1	SBDD	3HY9	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
57915	CC(=O)NC(=O)c1ccc(C(N)O)cc1	SBDD	3HY9	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

57901 to 57915 of 73725 items. Total 4915 pages.