Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
59701	Nc1ncnc2c1nc1n2C(CO)OC2(C1O)C(O)C2O	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59702	Nc1ncnc2c1nc1n2C1OC1C(O)OC(CO)C1O	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59703	Nc1ncnc2c1nc1n2C(CO)OC(C(=O)O)=C1O	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59704	CC1OC(C(O)C(O)CO)C(O)c2nc3c(N)ncnc3n21	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59705	Nc1ncnc2c1nc1n2C(CO)OC(CO)C(=O)N1	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59706	CC1OC(CO)C(O)C2OC2C2C3N1c1ncnc(N)c1N23	SBDD	4F1M	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59707	Nc1ncnc2c1nc1n2C(CO)OC(C(=O)OCCO)C1O	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59708	Nc1ncnc2c1nc1n2COC(CO)C(O)C(O)C1O	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59709	Nc1ncnc2c1nc1n2C1OC(CO)CO	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59710	Nc1ncnc2c1nc1n2COC(CO)C(O)C1=O	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59711	Nc1ncnc2c1nc1n2C(CO)OC(C(O)C2OC2O)C1	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59712	NC1N=CN=C2OC=CCC21	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59713	CC1OC(C(O)C(O)CO)Cc2nc3c(N)ncnc3n21	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59714	Nc1ncnc2c1nc1n2C(CO)OC2C(O)C12	SBDD	4F1M	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
59715	Nc1ncnc2c1nc1n2COC(CO)C1	SBDD	4F1M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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