Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
61981	O=CC(O)C(CO)COP(=O)(O)O	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61982	CC(O)C(COP(=O)(O)O)C1CO1	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61983	O=C(COP(=O)(O)O)C(O)CO	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61984	COC(C)C1OC1OP(=O)(O)O	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61985	COC(=COP(=O)(O)O)[C@@H]1O[C@@H]1O	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61986	O=P(O)(O)OC1C2OC2C2(O)C(CO)C12	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61987	O=P(O)(O)OCC(O)C(CO)OCO	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61988	C[C@H](OP(=O)(O)O)[C@@H](C=CO)[C@H]1CO1	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61989	O=P(O)(O)OC1OC1C(O)C(O)CO	SBDD	4P6P	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61990	O=COC(COP(=O)(O)O)C1OC1=O	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61991	O=P(O)(O)OC[C@H](CO)C(O)=CO	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61992	O=C1C(O)C(OCO)C(OP(=O)(O)O)C1O	SBDD	4P6P	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61993	O=C(O)C(OCO)C(O)COP(=O)(O)O	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61994	O=C1C(O)C(O)C(OP(=O)(O)O)C2OC12	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
61995	O=CC1(C(O)COP(=O)(O)O)OC1O	SBDD	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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