Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
54151	CN1CNc2cccc3cc(NC(=O)CN)cc1c23	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54152	CN1CCNC2(N)[CH]C3=C(N=C12)N1C(=NNC2CN21)N=C3	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54153	CC(O)C(O)C(O)C1=Nc2cc(O)cc3cccc(c23)N1	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54154	NCCCC1N=C2NCN=C3NCCC(N1)C32	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54155	CC1=CC2NC(N)(N)NC=C2C=N1	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54156	CC(C)Nc1ccc2c3c(ccc2c1)N3	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54157	O=C1Nc2cccc3cc(O)cc(c23)N1	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54158	CC1N=C2NCN=C3NCCC(N1)C32	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54159	CCN1CCOC2(C1)Nc1cccc3cc(O)cc(c13)N2	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54160	c1cc(-c2nnn3c2N=NC3)ccn1	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54161	NC=CC[C@@H]1N=C2NCN=C3NCC[C@@H](N1)[C@@H]32	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54162	OCC1=NC2CC3=NN=CC3C3NNC4C(C1)C234	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54163	NCC(=O)NC1=CC2=NC=NC3=CC=CC(=C1)C32	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54164	NC1(N)NCC2=C(C=C3C(O)CN4CC4N3C2)N1	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54165	CC(N)CN1CC2C=NC3=NCC4C(C)N4N3C2C1	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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