Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
54181	NC(N)(N)NCC1C2NC2N2CC12	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54182	CN1[CH]C2(C=C2)C(N2C=NNC(N)=N2)=C1	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54183	CCCCC1=NC23C4NC(N=C5NCC=C(N1)C542)N3C	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54184	C1=NC2=NNC3CN3N2C2N=C3NCCNC3C=C12	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54185	N=C(C=CCN1C=CC2=C(CNC(N)(N)N2)C1)NC1=NC1	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54186	NC(N)(N)NC1=C(C2CN2)[C]2NC2(O)N1c1ccccc1	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54187	C=C1NC2CC3NNCC3CC2C2=N[N]C3(CC3)N12	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54188	CCN1CNc2cccc3cc(NC(=O)CN)cc1c23	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54189	CC1OC1NC1=NC2C(=CC1)C=NC1=NNC3CN3N12	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54190	COC1=C2N=NN=CN2N=CN1c1ccccc1	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54191	OCC(O)C1OC12Nc1cccc3cc(O)cc(c13)N2	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54192	CC(=O)NCC1=NC23C4NC(N=C5N=CCC(N1)C542)N3C	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54193	O=C1CCCCN1C1=CC2=NC=NC3=CC=CC(=C1)C32	SBDD	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54194	COC(C)Nc1ccc2c(c1)CCNNC21CN1	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
54195	C1CC2CN2C2NC3CC4NNCC4CC3c3nnc1n32	SBDD	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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