Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
72856	O=C(C1CCC2C(C3=CCC=NC3)CN(c3cccnc3)C2O1)N1CCCC1	TargetDiff	6FTW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72857	CC(O)C1C(O)C2C3=C(OC(CO)C3)N(C(O)C(C)O)N2C2CCNC12	TargetDiff	6FTW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72858	CC(=O)N=CCC(C)=N[C@@H]1CC(=O)N[C@@H]1C=C1C2C(=CC=CC(F)=C2CO)N(C)[C@@H]1C	TargetDiff	6FTW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72859	O=C1OC(C(CO)P(=O)(O)O)C(C(O)OP(=O)(O)O)C2(O)OC(O)(F)C2C(OO)C1O	TargetDiff	4R74	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72860	O=P(O)(O)C1COC2OC(C(O)C3(O)C(O)OC23O)C1(O)O	TargetDiff	4R74	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72861	NC(=O)OCCOC(=COC[C@@H]1[C@H](C(=O)O)[C@@H](O)[C@](O)([C@H](O)OC(=O)C[P](=O)O)C[C@H]1O)C1=NCC(O)=CC1	TargetDiff	4R74	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72862	COC(C)C(O[P](=O)OP([O])[O])P(=O)(O)OC(F)C(O)COC(O)C(O)(O)C(C)C(C)O	TargetDiff	4R74	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72863	[O]P([O])OCC(O)C(O)COC1C(O)CC(O)(C(O)C(O)CP(=O)(O)O)C1(O)O	TargetDiff	4R74	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72864	O=C(O)CCC(CP(O)O)ON1OCOC1CC1C(O)C2C(C(=O)O)C(O)CC(O)(O)C2(O)C1O	TargetDiff	4R74	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72865	O=C(O)COCC(O)C(O)C1OCC(O)C(O)C(O)C(CO)O1.O=P(O)(O)O	TargetDiff	4R74	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72866	CC(O)C1C(O)C(C(=O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)OC(C(=O)O)C1C(=O)O	TargetDiff	4R74	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72867	CCCN1c2cccc(F)c2OS(O)(O)C2=C(C)CCC21	TargetDiff	6I62	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72868	FC(F)(F)c1cccc(C(C2=CC=CCC=C2)C2C=NC=CC2C2C=CC=CC2)c1	TargetDiff	6I62	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
72869	O=C(O)C1=CC(F)C2C(=C1O)N(c1ccccc1)C1=CC=CC=C3OCN2C31	TargetDiff	6I62	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72870	CCC1(C)CC(C)C(C)(C)C2CC(O)=C(O)C(C)C21	TargetDiff	6I62	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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