Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
19426	CCc1cc(NC(=O)N(C)Cc2ccccc2)ccc1-c1cccc(-c2cccc(C(=O)O)c2)c1	AlphaDrug	4X50	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19427	COc1ccc(CC2CCN(C(=O)C3CCCCCC3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19428	COc1ccc(CC2CCN(C(=O)C3C=CCN(C(=O)C4CCCCC4)C3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19429	COc1ccc(CC2CCN(C(=O)C3CCCN(C)CC3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19430	COc1ccc(CC2CCN(C(=O)C3CCN(C)CC3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19431	COc1ccc(CC2CCN(C(=O)C3CC=CCCC3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19432	COc1ccc(CC2CCN(C(=O)C3CCCN(C(=O)C4CCCCC4)C3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19433	Cc1cc(Nc2nc(-c3ccc4cn[nH]c4c3)ns2)nn1-c1ccc(C(=O)O)cc1	AlphaDrug	6I8T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19434	Cc1cc(Nc2nc(-c3ccccc3)ns2)cc(-c2ccc3ccccc3c2)c1	AlphaDrug	6I8T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19435	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NC3CCCN(C(=O)C4CC4)C3)nc3ccccc23)nc(-c2ccccc2)n1	AlphaDrug	6I8T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19436	Cc1cc(Nc2nc(-c3ccccc3)ns2)cc(-c2cn[nH]c2C(=O)O)c1	AlphaDrug	6I8T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19437	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NCc3ccccc3)nc3[nH]c(N4CCOCC4)cc23)nn2ccc(SC(C)(C)C)c12	AlphaDrug	6I8T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19438	Cc1cc(Nc2nc(-c3ccc(C(F)(F)F)cc3)ns2)ccc1-c1ccnc2[nH]c(-c3ccccc3)cc12	AlphaDrug	6I8T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19439	Cc1cc(Nc2nc(-c3ccccc3C(=O)O)ns2)ccc1-c1ccnc2[nH]c(-c3cc(F)cc(C(F)(F)F)c3)cc12	AlphaDrug	6I8T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19440	Cc1cc(Nc2nc(-c3ccccc3)ns2)cc2c1n(C)c(=O)n2CC(=O)NCc1ccccc1	AlphaDrug	6I8T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

19426 to 19440 of 73725 items. Total 4915 pages.