Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
38431	O=C(O)c1ccc(-c2cccc3c2C(=O)CS3)c(F)c1	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38432	CC1C2=C(CCC1O)c1cccc3c1C(CCC3)C2	Pocket2Mol	1COY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38433	CC(C)=C1C[C@@H]2[C@H](CC1=O)C[C@H]1Nc3ccccc3[C@]12C	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38434	CC1=C2CCc3cc4c(cc3C2CC1)C(C)(C)C(=O)O4	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38435	O=C1Cc2ccc3ccc(C(O)O)c4c3c2C(CC4)C1	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38436	Cc1cccc2c1C1CCC(C1)CN(C(C)O)C(=O)N2	Pocket2Mol	1COY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38437	Cn1c(=O)c(F)cc2ccc3c(c21)=C=CC=3CO	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38438	CC(O)(CC1CCC2C=Cc3cc(O)ccc3C21)C(O)O	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38439	C1=C(c2ccccc2)CC2CCCc3cccc1c32	Pocket2Mol	1COY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38440	CC1=CC(CO)C2NC3CCC(C)(O)c4ccc(c2c43)O1	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38441	COc1cc2c(cc1O)cc1c3c(cccc32)CCC1	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38442	OC1CCC2C(O)c3cc(F)ccc3C2C1	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38443	Oc1ccc2ccc3c(c2c1)CCc1ccccc1-3	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38444	CC1=C2CC(C)CCC2CC2=C1CCC(O)C2C	Pocket2Mol	1COY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38445	O=C(O)c1ccc2c(c1)CCc1ccccc1-2	Pocket2Mol	1COY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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