Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
49696	CC(=O)NC1C(=O)C(O)C(OP(=O)(O)O)C(O)C1O	Pocket2Mol	6N9L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49697	COc1ccc(O)c2c1OP(=O)(OP(=O)(O)O)OC2	Pocket2Mol	6N9L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49698	O=P(O)(O)OC1C(O)C(O)C(O)C(O)C1O	Pocket2Mol	6N9L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49699	O=C(O)C(O)C1OC(O)C(OP(=O)(O)O)C(=O)C1O	Pocket2Mol	6N9L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49700	O=C1c2cccc(O)c2C(O)C(O)C1OP(=O)(O)O	Pocket2Mol	6N9L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49701	O=C(O)C(=O)COP(=O)(O)O	Pocket2Mol	5YFT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49702	O=CC(CCC(=O)O)COP(=O)(O)O	Pocket2Mol	5YFT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49703	O=C(O)C1(OP(=O)(O)O)COC(OP(=O)(O)O)C1	Pocket2Mol	5YFT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49704	OC(O)C1OC(O)C(O)C1O	Pocket2Mol	5YFT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49705	Oc1cc(O)c(O)cc1O	Pocket2Mol	5XG5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49706	NC(C(=O)O)C(=O)O	Pocket2Mol	5XG5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49707	NC=C(C(=O)O)C(=O)O	Pocket2Mol	5XG5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49708	OC1COC(O)C(O)C1O	Pocket2Mol	5XG5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49709	Oc1ccc2ccoc2c1	Pocket2Mol	5XG5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
49710	O=C(O)C=CC(=O)O	Pocket2Mol	5XG5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

49696 to 49710 of 73725 items. Total 4915 pages.