Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
53971	COCC1CCC(C)Nc2cc(C)c3nc4cc(F)ccc4n3c2O1	SBDD	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53972	O=C(C1C2CCC34CC5CC5c5nc6cccc(c6n53)N=C(CN21)O4)N1CCCC(C2=NCCC(C(O)CO)O2)C1	SBDD	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53973	OCCN(C=C1O[C@H](CO)[C@@H]2O[C@@H]2[C@@H]1O)[C@H]1CC[C@@H](n2c(C[C@@H]3CN3)nc3ccccc32)OC1	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53974	N=CNC1CC(=O)n2c(nc3ccccc32)C1	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53975	NCC(CN(C1CO1)C(C(N)O)C1C2CCC3OC(=Nc4cccc5nc(C6CC6)n3c45)CN21)C1CCC(O)C1	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53976	CCCC(=O)NC1C2C(C)C(C(C)NCC(=O)N(C)Cc3cccc(NC(C)=O)c3)c3nc4cc(F)ccc4n3C12	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53977	CC(=O)Nc1cccc(CN2CCCC(NC(C)C3c4nc5ccccc5n4C4CC4C3C)C2=O)c1	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53978	NC(O)c1ccccc1	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53979	CC(O)C(=O)NC1[C]2N(C)N=CC21C(C)N1CCN(CCC2CCC3CC34[N]c3cc(F)ccc3N24)CC1	SBDD	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53980	Cc1ccc(C(=O)N2C[C@](C)(O)C[C@@H]2C=CC23C=C[C@@H](CCCN)N2C3)n2c1nc1ccccc12	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53981	CC(NCCNC(O)c1ccc(N2CC2=O)cc1)C1c2nc3ccccc3n2C2C(C1C)C2(F)F	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53982	NCC(CN(C1CC1)C1(C2C3CCC4OC(=Nc5cccc6nc(C7CC7)n4c56)CN32)CO1)C1CC(O)C(O)C1	SBDD	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53983	O=NCC(C(=O)N(C1CC1)C1(C2C3CCC4OC(=Nc5cccc6nc(C7CC7)n4c56)CN32)CO1)C1CCC(O)C1	SBDD	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53984	COC1OC1(C1C2CCC3OC(=Nc4cccc5nc(C6CC6)n3c45)CN21)N(CC(CN)C1CCC(O)C1)C1CC1	SBDD	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53985	O=C1CCCC(F)c2nc3ccccc3n21	SBDD	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

53971 to 53985 of 73725 items. Total 4915 pages.