Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
58171	O=C1NCC(c2ccccc2)CN1c1ccccc1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58172	C1=NC=C(c2ccccc2)CN1c1ccccc1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58173	C1=C(c2ccccc2)CN2C(=N1)CCC1(C3CC3)CC21	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58174	CC1CCOC2=NCC(c3ccccc3)CN21	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58175	CC1=C(c2ccccc2)CN(c2ccc(CC(=O)NC(=O)C3=NN(C)C4=CC=CCC4=C3)cc2)C=N1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58176	CC1(C(NC2=NC(N)c3ccccc3[N]2)C2CC2)CC1	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58177	NC1=C(c2ccccc2)C2=CC=C3C=C(OCO)C=CC3N2C=N1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58178	OC1CC1(C=C=C(c1ccccc1)C1CO1)C1CN1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58179	O=C1N=CCCC1c1ccccc1	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58180	c1ccc2c(c1)CN=C(NC1(C3CC3)CC1)[N]2	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58181	N[C]1N=CN(C2=CC3=C(C=CC2)O3)C2CC12c1ccccc1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58182	c1ccc2ncccc2c1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58183	CC12CC1CC(c1ccccc1)C(=N)NC1NC12	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58184	NC1[N]C(NC2CC2)=Nc2ccccc21	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58185	O=C(O)c1ccc2ccccc2c1	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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