Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
58186	COC1=CC2=CC=COC2C=C1	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58187	CC(C)NC1=Nc2ccc(N3CC3)cc2C(=N)[N]1	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58188	CCOC1C=C(c2ccccc2)C(=O)NC1	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58189	c1ccc2c(c1)C[N]C(NC1CC1)=N2	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58190	C1=CCC(NC2=Nc3ccccc3C[N]2)=C1	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58191	NC1=C(c2ccccc2)CN(c2ccc(OCO)cc2)C=N1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58192	C1=NC2=C(CN1c1ccccc1)c1ccccc1OC2	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58193	O=C(Cc1ccc(N2C=NC=C(c3ccccc3)C2)cc1)N1CC2=C(OC3C=CC=CC3=C2)C2OC21	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58194	NC1N=C(C(O)Cc2ccccc2)Nc2ccccc21	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58195	CC(CO)CCOC1C=C(c2ccccc2)C(=O)NC1	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58196	CC1CCCCCC2CC23Oc2cc(N4C=NC(N)=C(c5ccccc5)C4)ccc2OC13	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58197	NC(=O)C1CCC(NC2=NCc3ccccc3[N]2)C1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58198	CC1C=CC2=C(O1)C(c1ccc(N3CC(c4ccccc4)C=NC3=O)cc1)C(O)N2	SBDD	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58199	NC1=C(c2ccccc2)CN(C2=CC3=C(C=CC2)O3)C=N1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
58200	O=C1N=CC(c2ccccc2)CN1c1ccccc1	SBDD	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

58186 to 58200 of 73725 items. Total 4915 pages.