Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
65836	CCON1CC(c2ccccc2)C2=C(OCC(NCCNCC(C)=O)C2)c2sc(C(C)C)cc21	TargetDiff	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65837	CCCC1CCC2CC3N4CC(C(C)C)C(=O)C4C(OC)SC3(C)CC2CC1	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65838	CC1CC2C(CC34C(O)C(CC(O)CO)C5OC(C(C)C)C(C)(O)CC5(O)C3CC24)C(C)O1	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65839	CCC(CC)OC1NC2(CCC2)CCC2C3CCC2NC(=O)CN2CC(=O)OCC2C(=O)NC(C(=O)O)CN(CS1)C3	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65840	CN1NC(C2C=CC=C(OC(=O)O)C=C2)=NC1c1ccccc1	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65841	CC(C)CC(CC(O)C(O)C(C)CCCC(CC(C)C)C(C)O)C(C)C	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65842	CCOC(CC)CC1CCC2C3CCC2(C1)CC(C1C=C(Cl)C(O)=CC1)C3O	TargetDiff	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65843	CC(CO)CC1C=CC2=C(C=CCC=C2)C1NCCC1CNC2C(=CCC=C2OC(C)C)CC1CCO	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65844	CCCC(C)N1CC2c3cncc(C(CN)CC(C)O)c3C(O)C(CC)C2C1	TargetDiff	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65845	NC(O)(CC(=O)NC(=O)C1CCN(c2cccc3ccncc23)C(O)C1CO)OCS	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65846	COc1c(O)ccc2c1C(O)=CC1C2OC(OCC(O)C(CO)C2CCC(CP(=O)(O)O)C2)C(O)(C2CC(CO)O2)C1OC	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65847	CCC(C1CCC(CCC(C)C)CC1)C1C(CO)COC(C)C1C	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65848	CCCCCC(C)CC1N=CC(C(=O)NC(=O)C2C(C)CC(S(O)(O)O)C2NC)=NC1C	TargetDiff	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65849	CCC(C)(C(=O)NC1=CC=CCC=C1)C(CO)CC1CCC(C)CC(=O)OCCCC(CC(N)=O)C1	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65850	CCOC1=CN(C2CCC(CO)C(C3CCCC(O)C3C)C2C)CC(CO)O1	TargetDiff	3O96	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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