Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
8686	CC(=O)N1CCN(c2cc(-c3ccc(-c4cccc(-c5ccccc5)c4)cc3)nc(N(C3CCCC3)C3CCCC3)n2)C2CCC(C2)C1	AlphaDrug	5MWH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8687	CC(C)(C)c1ccc(-c2cc(C(=O)O)ccc2CCCC(N)=O)cc1	AlphaDrug	5MWH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8688	CC(C)(C)c1ccc(-c2cc(C(=O)NC3CCN(C4CC4)CC3)ccc2Cc2ccc(Cl)c(Cl)c2)cc1	AlphaDrug	5MWH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8689	CC(C)(C)c1ccc(-c2cc(C(=O)O)ccc2-c2ccc(C(=O)NCCCN)cc2)cc1	AlphaDrug	5MWH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8690	CC1CCC(Nc2cc(-c3cc(-c4ccc(-c5cnn[nH]5)cc4)cc4ccccc34)ccn2)CC1	AlphaDrug	5MWH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8691	CN1CCC(C(=O)Nc2c(Cl)cc(-c3ccc(C(C)(C)C)cc3)cc2Cl)CC1	AlphaDrug	5MWH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8692	CC(C)(C)c1ccc(-c2cc(-c3ccc(-c4cn[nH]n4)cc3)ccc2Cc2ccc(C(=O)O)cc2)cc1	AlphaDrug	5MWH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8693	CC(/N=C/CCCNC(=O)OCCCC(=O)O)c1ccc(Cc2ccc(C(=O)O)cc2)c(-c2ccc(C(C)(C)C)cc2)c1	AlphaDrug	5MWH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8694	Cc1cccc2ccc(CN3CCCC3NC(=O)c3ccc(N4CCCC4)cc3)cc12	AlphaDrug	6G2C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8695	Cc1ccc2cccc(CNC(=O)c3ccc(CN4CCC(C(=O)Nc5ccc(C(F)(F)F)cc5)CC4)cc3F)c2c1	AlphaDrug	6G2C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8696	Cc1ccc2cccc(CNC(=O)C3(C(=O)N4CCN(c5ccc(C(F)(F)F)cc5)CC4)CCCC3)c2c1	AlphaDrug	6G2C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8697	Cc1ccc2cccc(CNC(=O)CN3CCC(C(=O)N4CCN(c5ccc(C(F)(F)F)cc5)CC4)CC3)c2c1	AlphaDrug	6G2C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8698	Cc1ccc2cccc(CN(CC3CCCC3)C(=O)N3CCN(c4ccc(C(F)(F)F)cc4)CC3)c2c1	AlphaDrug	6G2C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8699	Cc1ccc2cccc(CNC(=O)c3ccnc(N4CCCC4)c3)c2c1	AlphaDrug	6G2C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8700	Cc1ccc2ccc(NS(=O)(=O)c3ccc(Nc4ccc(C(F)(F)F)cc4)cc3)cc2c1	AlphaDrug	6G2C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

8686 to 8700 of 73725 items. Total 4915 pages.