Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14251	COc1ccc(-n2c3ccc(C(=O)NCc4ccccc4C(F)(F)F)cc3c(=O)n2C)cc1	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14252	CC(C)(C)c1cc(NC(=O)Nc2ccc(-c3ccccc3)cc2)nn1Cc1ccc(C(F)(F)F)cc1C(F)(F)F	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14253	CC(C)(C)NC(=O)NC1CCCCC1Cc1ccc(-c2ccc(C(=O)NC3CCCC3)cc2)cc1	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14254	CC(C)c1ccc(NC(=O)N2CCC(NC(=O)c3ccc(C(F)(F)F)cc3Cl)CC2)cc1	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14255	CC(C)(C)c1cc2cc(OCc3ccccc3C(F)(F)F)ccc2n1Cc1ccc(C(=O)NC2CC(=O)NC(C(F)(F)F)C2)cc1	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14256	CC(C)(O)c1ccc(NS(=O)(=O)c2ccc(C(F)(F)F)cc2)cc1	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14257	CC(=O)N1C=CC(Nc2cc(Cl)ccc2C(=O)NCc2ccc(OC(F)(F)F)cc2)=CC1	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14258	CCNC(=O)N1CCCC1C(=O)NC(C(=O)NC1CCCCCCCCc2ccc(OC(=O)N3CCOCC3)cc2C1)C(C)C	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14259	COc1ccc(CN2CCN(c3cc(C(=O)N4CCCC4)ccc3Cl)CC2)cc1C(=O)NC1CCCCN(C(=O)C2CCCCC2)C1=O	AlphaDrug	5CSO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14260	CC1(C)CCC(NCc2ccc(-c3cccc(CCCCC(=O)O)c3)cc2)CCC(C)(C)C1	AlphaDrug	5FSX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14261	CCC(C)n1cc(-c2nc(-c3cc(-c4cccc(C(=O)NCC5CCCCCC5)c4)ccc3O)no2)cn1	AlphaDrug	5FSX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14262	CC(C)(C)CNC(=O)c1ccc(=O)n(-c2cc(C(=O)Nc3cccc(O)c3)ccc2CNC2CCC(C)(C)CC(C)(C)CC2)c1	AlphaDrug	5FSX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14263	CC1(C)CCC(NCc2ccc(-c3cccc(/C=N\C(=O)c4cccc(S(C)(=O)=O)c4Cl)c3)cc2)CCC(C)(C)C1	AlphaDrug	5FSX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14264	CC1(C)/C=C\C(NC(=O)c2cc(-c3cccc(F)c3)c(Cl)cc2O)CCC(C)(C)C1	AlphaDrug	5FSX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14265	CC1(C)CCC(NCc2cc(-c3cccc(C(=O)NCC(F)(F)F)c3)ccc2-c2ccccc2)CCC(C)(C)C1	AlphaDrug	5FSX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14251 to 14265 of 73725 items. Total 4915 pages.