Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
18571	Cc1ccc(Nc2ncc(C(=O)O)s2)cc1	AlphaDrug	5MRP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18572	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(-c5ccc(C(=O)O)cc5)cc4o3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18573	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4cc(C(=O)N5CCC(C(C)(C)C)CC5)ccc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18574	Cc1cc(C(=O)N2CCN(C(=O)NC3CCCCCC3)CC2C)nc(-c2ccc(C)c(N)c2)n1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18575	CN(C)c1cccc(C2C=CCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(C(=O)N6CCCC6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18576	CN(C)c1ccc(-c2ccc(C(=O)NCC(O)c3ccc(C(F)(F)F)cc3)c(N)c2)cc1	AlphaDrug	3DAF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18577	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(c6ccccc6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18578	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(C(=O)c6cc7ccccc7o6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18579	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(c6ccccn6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18580	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(C(=O)NC(=O)c6ccc7ccccc7n6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18581	CN(C)c1cccc(C2CCN(C(=O)C(CCCC(=O)N3CCC(C(=O)O)CC3)c3cccc(C(=O)O)c3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18582	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(c6ccc7c(c6)CCCCO7)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18583	CN(C)c1cccc(C2CCN(C(=O)NC(=O)c3ccc4ccccc4c3)CC(F)(F)C(=O)N3CCC(CC3)C2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18584	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc(S(=O)(=O)c4ccc(OC5CCCC5)cc4)cc(N)c3O)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18585	CN(C)c1cccc(C2CCCN(CC3CCC3)CC2C(=O)NC(=O)c2ccc3ccccc3c2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

18571 to 18585 of 73725 items. Total 4915 pages.