Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
18631	CN(C)c1cccc(C2CCCN(CC3CCN(C(=O)c4ccc(C(C)(C)C)cc4)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18632	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(c6ccc(F)cc6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18633	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(c6cccc(C(=O)O)c6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18634	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(C(=O)c6cc7ccccc7[nH]6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18635	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(Cl)cc4[nH]c3=O)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18636	CN(C)c1cccc(C2CCCN(CC(=O)N3CCC(C(=O)Nc4ccc(C(F)(F)F)cc4)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18637	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5C=CN(c6ccc7ccccc7n6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18638	CC(C)C(=O)N1CCC(c2ccc3cc(C(=O)N4CCCC(c5cccc(N(C)C)c5)CC4)[nH]c3c2)CC1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18639	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCN(C(=O)NC(=O)c6ccccn6)CC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18640	CN(C)c1cccc(C2CCCN(CC3CC3)CC2C(=O)NC(=O)c2ccc3ccccc3c2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18641	CN(C)c1ccc(-c2ccc(C(=O)N3CCC(N4CCC(C(=O)N5CCC(O)CC5)CC4)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18642	CN(C)c1cccc(C2=CCCC(NC(=O)c3cc(-c4cccc(C(=O)O)c4)no3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18643	Cc1cc2cc(C(=O)N3CCCC(c4cccc(N(C)C)c4)CC3)[nH]c2cc1N	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18644	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)NC(=O)c3ccc4ccccc4c3)CC(=O)N3CCC(CC3)C2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18645	CN(C)c1cccc(C2CCCN(C(=O)c3cc4ccc(C5CCNCC5)cc4[nH]3)CC2)c1	AlphaDrug	3DAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

18631 to 18645 of 73725 items. Total 4915 pages.