Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
21721	Cc1cc(-c2nc3cc(C4CC4)cc(NS(=O)(=O)c4ccc(Cl)cc4)c3[nH]2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21722	Cc1cc(-c2[nH]c3cc(C(=O)N4CCCCC4)cc(NCCCO)c3c2C)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21723	Cc1cc(-c2nc3cc(NS(C)(=O)=O)ccc3[nH]2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21724	Cc1cc(-c2nc3cc(C4CCCNCC4)cc(NS(=O)(=O)c4ccccc4Cl)c3[nH]2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21725	Cc1cc(-c2cc(F)cc(NS(=O)(=O)c3ccc(NC(N)=O)cc3)c2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21726	CC(O)CN1CCC(Oc2ccc(S(=O)(=O)c3ccc4ccccc4c3)cc2)CC1	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21727	Cc1ccc(-c2cc(F)cc(NS(=O)(=O)c3ccc(NC(N)=O)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21728	CN(C)CC(=O)c1ccc([SH](=O)(CC2CCCCC2)C2CCCCC2)cc1	AlphaDrug	4RLU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21729	Cc1cc(-c2nc3cc(C4CC=CCC4)cc(NCC(O)CO)c3[nH]2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21730	Cc1cc(CC2(NC(=O)c3ccc(-c4ncnn4C)cc3)CCCC2)nc2ccccc12	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21731	Cc1cc(-c2nc(CC3CCCC3)c(-c3ccc(NS(=O)(=O)c4cccc(F)c4)cc3)s2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21732	CN(C)CCNC(=O)c1ccc([SH](=O)(Nc2ccc(C3CC3)cc2)c2ccc(Cl)c(Cl)c2)cc1	AlphaDrug	4RLU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21733	Cc1cc(-c2cc(F)cc(NS(=O)(=O)Cc3ccc(Cl)cc3)c2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21734	Cc1cc(-c2[nH]c3cc(C(N)=O)cc(C)c3c2C)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21735	Cc1cc(-c2[nH]c3cc(C(=O)NC4CCCCC4)cc(NS(C)(=O)=O)c3c2C)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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