Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
21736	Cc1cc(-c2nc3cc(C4CCCCC4)cc(NS(C)(C)(C)=O)c3[nH]2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21737	Cc1cc(-c2nc3cc(C4CCCCC4)cc(NS(=O)(=O)c4ccccc4Cl)c3o2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21738	Cc1cc(-c2nc3cc(C4CCNCC4)cc(NS(=O)(=O)c4ccccc4)c3[nH]2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21739	Cc1cc(-c2nc(C3CC3)c(-c3ccc(F)c(NS(=O)(=O)c4ccccc4)n3)s2)ccc1O	AlphaDrug	4RLU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21740	CN(C)C(=O)Cc1ccc(-c2ccc(N3CCN(S(C)(=O)=O)CC3C(=O)c3ccc(Cl)cc3)cc2)cc1	AlphaDrug	6M8Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21741	CN(C)C(=O)Cc1ccc(-c2ccc(N3CCN(C(=O)O)CC3C(=O)c3ccc(C(F)(F)F)cc3)cc2)cc1	AlphaDrug	6M8Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21742	CN(C)C(=O)Cc1ccc(C2CCN(C(=O)CN(CC(=O)NCc3ccccc3)C(=O)c3ncc(Cl)cc3-c3ccc(Cl)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	6M8Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21743	CC1=C(C(=O)N(C)C)C(C)(C)C12CCN(C(=O)c1ccc(Cl)cc1Cl)CC2	AlphaDrug	6M8Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21744	CN(C)C(=O)Cc1ccc(C(=O)N2CCC(c3ccc(Cl)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	6M8Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21745	CN(C)C(=O)Cc1ccc(-c2ccc(N3CCN(S(C)(=O)=O)CC3=O)cc2)cc1	AlphaDrug	6M8Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21746	CN(C)C(=O)Cc1ccc(-c2ccc(C(Cc3ccc(O)c(C(=O)O)c3)c3ncc(Cl)cc3-c3ccccc3)cc2)cc1	AlphaDrug	6M8Q	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21747	Cc1cc(N(C)C)ccc1C(=O)C1CN(C(=O)Cc2ccc(O)c(O)c2)CCN1c1ccc(-c2ccc(CC(=O)N(C)C)cc2)cc1	AlphaDrug	6M8Q	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21748	Cc1cc(C(=O)N2CCN(C)CC2)ccc1C(=O)C1CN(C2CC2)CCN1c1ccc(-c2ccc(CC(=O)N(C)C)cc2)cc1	AlphaDrug	6M8Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21749	CN(C)C(=O)Cc1ccc(-c2ccc(Cl)cc2)c(Cl)c1	AlphaDrug	6M8Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21750	Cc1ccc(C(=O)N2CCC(N3CCCC3)CC2)cc1NC(=O)n1c(C)nc2ccc(-c3cc(Cl)ccc3Cl)cc21	AlphaDrug	5CAP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

21736 to 21750 of 73725 items. Total 4915 pages.