Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
21796	Cc1ccc(-c2ccc(CN3C(=O)CN(c4ccc(C(F)(F)F)c(Cl)c4)C3=O)cc2)cc1NC(=O)NC(CC(C)(C)C)c1ccc(-c2cccnc2)cc1	AlphaDrug	6FAG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21797	CN1CCN(C(=O)c2ccc(OC3(C)C=CN(c4ccc(NC(=O)NC(CC(C)(C)C)C(=O)O)cc4)CC3)cc2)CC1	AlphaDrug	6FAG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21798	Cc1ccc(-c2ccc(CN3C(=O)CN(c4ccc(C(F)(F)F)cc4)C3=O)c(Cl)c2)cc1NC(=O)NC(CC(C)(C)C)c1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	6FAG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21799	CC(C)(C)CC(NC(=O)Nc1cc2cc(-c3cnn(CC(=O)O)c3)ccc2cn1)c1ccc(C(=O)O)cc1	AlphaDrug	6FAG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21800	Cc1c(Cl)cccc1-c1ccc(-c2ccc(Cl)c(N3CCC(c4ncc(-c5ccccc5)s4)CC3)c2C)nc1Cl	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21801	Cc1c(-c2ccc(Oc3cccc(C(=O)NC4CCN(c5cccc(F)c5)C4)c3)cc2)sc2ccc(O)cc12	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21802	Cc1cc(N2CCCCC2)ccc1-c1ccc(-c2cccc(Cl)c2C)c(Cl)n1	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21803	Cc1c(Cl)cccc1-c1ccc(-c2ccc(Cl)c(N3C=CC(NC(=O)CO)CC3)c2C)nc1Cl	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21804	Cc1c(Cl)cccc1-c1ccc(-c2ccc(Cl)c(N3CCC(NC(=O)c4ccc(Cl)cc4)CC3)c2C)nc1Cl	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21805	Cc1ccc(-c2c(Cl)ccc(-c3ccc(-c4cccc(Cl)c4C)c(Cl)n3)c2C)nc1N1CCCCC1	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21806	Cc1c(Cl)cccc1-c1ccc(-c2ccc(Cl)c(N3CCC(c4ncc5ccccc5n4)CC3)c2C)nc1Cl	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21807	Cc1cnc(NC(=O)C2CCN(c3ncc(Cl)cc3Cl)CC2)c(N2CCC(C(=O)O)CC2)n1	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21808	Cc1c(Cl)cccc1-c1ccc(-c2ccc(Cl)c(COCC(O)CO)c2)nc1Cl	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21809	Cc1c(Cl)cccc1-c1ccc(-c2ccc(Cl)c(N3CCC(NC(=O)OC(C)(C)C)C3)n2)nc1Cl	AlphaDrug	6RFW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
21810	Cc1cc(-c2cccc(-c3ccccc3)c2)cc(NC(=O)NC2CCCC2)c1C	AlphaDrug	4O3F	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

21796 to 21810 of 73725 items. Total 4915 pages.