Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
2506	CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)OCc1ccc(-c2cc(Cc3ccccc3)n[nH]2)cc1)C(=O)O	AlphaDrug	5J82	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2507	CC(C)(CCc1c[nH]c2ccccc12)C1CCCN1Cc1ccc(-c2cc(-c3ccccc3)ccc2OCCCOc2cncnc2)cc1	AlphaDrug	5J82	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2508	CC(C)Oc1cc(-c2cncc(C(=O)O)c2)ccc1C(C)(C)C	AlphaDrug	5J82	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2509	COc1ccc(-c2cc(CCC(O)C(=O)O)ccc2C(=O)NC(Cc2ccccc2)C(=O)O)cc1	AlphaDrug	5J82	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2510	CC(C)(C)c1cc2c(cc1O)C(=O)C(C(=O)N1CCC(c3ccc(C(=O)O)cc3)CC1)CC2	AlphaDrug	5J82	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2511	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(COc3cc(-c4ccoc4)nc4cc(OC)ccc34)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2512	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(COc3cc(C(=O)O)nc4cc(OC)ccc34)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2513	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(C(=O)NCC3CCN(CC(=O)O)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2514	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(C(O)CN3CCC(N(C)C)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2515	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(COc3cc(C(=O)O)nc4cc(C#N)ccc34)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2516	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(COc3cc(N4CCOCC4)nc4[nH]c(=O)[nH]c34)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2517	CS(=O)(=O)Nc1ccc(-c2ccc3cc(OCc4ccc(F)cc4)ccc3c2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2518	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(COc3cc(C4CCCCC4)nc4[nH]c(=O)[nH]c34)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2519	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(COc3cc(N4CCC4)nc4cc(OC)c(OC)cc34)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2520	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(COc3cc(C4CCC4)nc4cc(OC)ccc34)cc2)cc1	AlphaDrug	4C1Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

2506 to 2520 of 73725 items. Total 4915 pages.