Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
65656	CCC(=O)NCCC1CCCC(N2NC3C(=C(C(C)C)C4=CC=CC(C)C43)C2=O)C1	TargetDiff	5IA4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65657	C[C@@H](O)C(O)=C1CCCN1CC1CC2=C(CC(=C(CO)OCC(=O)O)C2)C1	TargetDiff	5IA4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65658	CC(CC(C)C1CCCCC1)c1ccc(C(=O)NCCc2ccc(Cl)cc2)cc1	TargetDiff	5IA4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65659	CC1=CC(C2C(=O)OC(C3CCC(C)O3)=C2C2=NCNN2)C=CC=C1	TargetDiff	4M0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65660	O=C1C2=C3OC4c5c1cccc5N1C5CCCC5C(C(O)CCOCCC3CC2)C41	TargetDiff	4M0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65661	Cc1cnc2c(n1)=C=C1C3=C(C=CCC=C3)N=C3N=CC4=C(C=2OCC4C)N13	TargetDiff	4M0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65662	ONc1ccc2c(c1O)[C@@H]1C3=C(C(=C4C=CCC=N4)[C@@H]1O2)N(O)CC=C(O)[C@H]3O	TargetDiff	4M0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65663	OC12C3CNNC3=C3CCCC4CCCC5CC6CCCC1C6C5C4C32	TargetDiff	4M0Y	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65664	CC1=C(CNC(=O)CC=C(Oc2ccc3c(c2)[C@H](C)N=C3NC[C@H](O)CC(=O)O)C2=CNN(C)C=C2)C=C[C@H](F)C1O	TargetDiff	4M0Y	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65665	O=c1nc(CCO)cnc2c1=CCC1Cc3ccccc3C=21	TargetDiff	4M0Y	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65666	C1=CC2=C3N4/C(=C\CCNc5ncccc54)N=C4NCN(C2=CC1)N43	TargetDiff	4M0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65667	CC1C=NC(C)C2=C1OC(C(O)CCO)N2	TargetDiff	4M0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65668	CC1C=C(C2NC(=O)C3C=C4NN5c6ccccc6C(CN)(CCN6CC(=O)NC(C)C6=O)C5C4C=C32)CCN1	TargetDiff	4M0Y	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65669	CC1=CC(=N)C(=N)CC=C1C(O)C(O)CCC(O)COP(=O)(O)O	TargetDiff	4OZJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65670	CC1=C2C(=O)C(C)C(COC3COC4=C3C(OOP(=O)(O)OP(=O)(O)O)C=C(O)C4)=NC2N(C=N)N1	TargetDiff	4OZJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

65656 to 65670 of 73725 items. Total 4915 pages.