Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
65716	NC1=CN2C3=CC(F)C=CC=C3CC2(F)c2cccc(S(O)(O)O)c21	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65717	CCC(O)C(C)C1C(=O)C(C)C2CCC(=O)C2C(=O)C1O	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65718	O=C(O)C1CCCC1	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65719	CCS([O])([O])CC1CNCC1C1CCC2OCCC2C1	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65720	CN(C1=C=C(c2ccccc2)CCOC1=O)C1C=CC(NNS(O)(O)O)C=C1O	TargetDiff	4YXI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65721	CC1=CN2C(=O)c3ccccc3C2C2NC(=O)C(O)C(=O)CC3CCC1=C32	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65722	CC1CCCC2(CSC(C(N)(O)O)C2=O)O1	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65723	NS(N)(O)c1cc(OO)c2c(c1)C(C(=O)O)CSC2	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65724	NS([O])([O])C1=CCC=CC1	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65725	O=C(O)CC(CO)C(=O)OCO	TargetDiff	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65726	CN1C(=O)CC(C(C)(O)O)C1=O	TargetDiff	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65727	CC1(O)CC(C(=O)O)CC(O)(C(=O)O)C1	TargetDiff	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65728	CCN(C)CCOC(=O)C(CCOCC(O)C(COP(=O)(O)O)OP(=O)(O)O)C(O)C(O)C(O)C(C)OC(O)COP(O)O	TargetDiff	2E6D	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65729	NP(=O)(O)CCP(=O)(O)O	TargetDiff	2E6D	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65730	O=C(O)CC1C(O)C(O)C(O)C2CC(O)OC12	TargetDiff	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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