Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
66016	Cc1nc2c(n1[C@@H]1CCCCO1)C(=C=CCC=C1CCCNCC1)CC=C2	TargetDiff	5FSN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66017	C[C@H](O)[C@H](CO)C(=O)OCC(=NC1=NCCC1)NCCN	TargetDiff	5FSN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66018	CC1=C(O)C2N=NC(=N)N=C(NC3C(CO)CCC4CC3C4)C2C=C1	TargetDiff	5FSN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66019	CCC1C(O)C2CC(F)C(F)=C[SH]2C1C1=NC=C(C)C2C(Cl)CCC12	TargetDiff	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66020	C1=CCC=C(Nc2cccnc2C2C=CCC=N2)C=C1	TargetDiff	5FSN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66021	CC(C)c1cccc(N2C3=C(OC(CO)C3)C(=O)C3C=NC(=O)C=CC32)c1	TargetDiff	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66022	CC1=NN=C2C3C=CC=CC3=C3C4CC=CC5=CCC=CC=C5C4CC(C1=O)C23	TargetDiff	5FSN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66023	CC(C1C=CCC(O)=C1)C12CNC(=O)N=C1NC1=NC(Cl)C=CC12	TargetDiff	5FSN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66024	O=C(CCNCC1N[C@@H](Cl)[C@H](F)O1)N=CCO	TargetDiff	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66025	CC1=CCC=CC1.COCCOCCCCCCO.OC(F)(F)F	TargetDiff	4YNL	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66026	CC1=C2NNCN2CC1.CCCCNN.CCO.FC(F)(F)c1ccccc1.c1ccccc1	TargetDiff	4YNL	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66027	CCOC[C@@H](O)CCOCCCC(=O)O.N=CCCC=CCN(F)C(=O)O	TargetDiff	4YNL	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66028	C[C@@H](CC=CCNCCCCC=CC=CCNc1ccccc1)CNC1=CC=CC(O)=CC1	TargetDiff	4YNL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66029	CCCCCCNC(=O)NCC(NC(=O)NCCCCCC)C(N)=O.N=C(CF)c1cccc(C(=O)NCCNC(=O)C2COCO2)c1	TargetDiff	4YNL	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66030	CC(F)(F)F.CCCCC(CCCNC(=N)C(=O)O)NCCO.NCc1ccc(O)c(F)c1	TargetDiff	4YNL	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔

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