Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
67996	CCOC1COc2ccc(cc2)C2=C3C(CC(C)C3NC3CC4(O)C(O)C(CN)CC4C31)NC2	TargetDiff	4MO4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67997	CC(=O)C1CCC2C3=C(CCC3)C(=O)N3C(=O)C(Cc4ccc(Cl)cc4)C3C(CO)C2C1C(=O)O	TargetDiff	4MO4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67998	O=C1c2cc(=O)ncnc2NC2(C1O)C(O)C(O)C(O)C2NS(O)(O)O	TargetDiff	4MO4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67999	Fc1ccc2c(c1)OCCCO2.OC1C(Cc2ccccc2)OC2=CC(C3CNN3)C=C(Cl)C2C1O	TargetDiff	4MO4	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68000	N=C1N=CCC(NC2OC(COP(=O)(O)O)C(O)C(O)C2O)=N1	TargetDiff	4MO4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68001	CC1OC2CC(=CC1C(=O)O)C(O)C(O)C(P(=O)(O)OP(=O)(O)O)OCCCC(O)C(O)C2	TargetDiff	4MO4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68002	COC1=C(O)C2CCCC(CC(=O)O)OCCC(O)C3C=CCC=CC3OC2C=C1	TargetDiff	4MO4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68003	Cc1ccccc1C(O)C(C1C=CC=CC=C1)C(C)OC1CN2C(=O)NC(=O)C2N1C=N	TargetDiff	4MO4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68004	CC(=O)C1CC2CCC(O)/C2=C2\CC(C)CC(C2)C(=O)OC(C(O)CC(O)P(C)(=O)O)C(O)C1O	TargetDiff	4MO4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68005	Cc1ccc2c(c1)C1NNC3=C1C(CN3)C1CCCCCC(C1)SC2	TargetDiff	5CEP	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68006	C1=CC2SC3=C4C2=C2C1=CCCC2C4N=CC3	TargetDiff	5CEP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68007	CCCCC(C)C1=C2C(=O)C=CC3=C2C2=C1CCN2CC3	TargetDiff	5CEP	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68008	N#CC1=CC2C(C=C1)c1cccc3c1OC1C(Cc4ccccc4C1CC(O)C2(O)O)O3	TargetDiff	5CEP	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68009	O=C(O)C1c2ccccc2-c2c1cc(F)c(O)c2O	TargetDiff	5CEP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68010	CCCC1=C(C)CNC1CNC1=CC2C(CC(C)C(C)C2C(=O)O)N=N1	TargetDiff	5CEP	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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