Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
71956	N=C1C(c2ccccc2)CC2N(Cc3c(Cl)ccc(CO)c3CN)CNN=CN12	TargetDiff	4XLI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71957	CN(C)C1=CCC2C(=C1N)CONCC1CC3C(=O)N=CC4=CCCC(C43)C12	TargetDiff	4XLI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71958	COC1=C=C(O)C2CNC3=NCC(C(C)(O)CC(C)O)(OC32)C(C(O)CO)C2OC(CCc3c(C)ccnc31)CCC2O	TargetDiff	4XLI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71959	COC(=O)C1NC(=O)C2=C1c1c(nc3n1C(C1C(F)=CCC=C1C1CNCC1O)CN3)C2=O	TargetDiff	4XLI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71960	COC12CC(O)CC1CC1=C(N2)C(=N)NC2=C(CCN2)N1	TargetDiff	4XLI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71961	CC1=CC2C(=O)C3=C(CC4(OC(=O)C5=C4C(F)C(F)C=CC5)C3=N)C(c3ccccc3)C2=CC1	TargetDiff	4XLI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71962	Nc1ccc(C2=CC=NC3C=CCC=CC3=C2)cc1	TargetDiff	4XLI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71963	C=C(C)C1CCCc2cccc(c2)-c2nc(nc3c2CCC3)CC2CC(NC2=O)C1C1N=CCC=N1	TargetDiff	4XLI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71964	CC1NC2CNC3C(=O)C=CC4(CN=C5C6=C4CCN6N=Cc4c(F)cccc45)C1=C23	TargetDiff	4XLI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71965	COC1=C(O)C(CC(C)=C=CC2=C=C3C(F)C=NNC3C(N)=C=C(NCC(C)O)CCC2)CC1	TargetDiff	4XLI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71966	Cc1ccc(C2C=NCC3=C=CC(CO)OC4C=CC=CC4N(C)C32)cc1	TargetDiff	4XLI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71967	CC1=C(N)C(C2=NNC=C(NC3=C4CCNC4C(=O)N3C)N2C)CC1C	TargetDiff	4XLI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71968	CCCC1=NC=C2CNc3ncc4c(=O)nccc-4n3C2c2cnccc21	TargetDiff	4XLI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71969	CC1(O)OC2CCCN3OC4=CC5=CC(O)=CCC5=CC(=C4C23)CC2CCCC2C2NC(=O)C3CC(CO)CCC1C3O2	TargetDiff	4XLI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71970	CC(=O)C1C=NC(=N)C(CN(C(=O)CC(C)O)C2=CNCC=N2)=C1	TargetDiff	4XLI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

71956 to 71970 of 73725 items. Total 4915 pages.