Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
72001	CCC1c2ccccc2C(C(O)C2CC3CCC(C)C(O)C4=NC(OC)C=CC4N3C2=O)C1(O)O.CN	TargetDiff	5F2U	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72002	CCNCC1C=C2CC#C/C=C\CC[C@@H]3/C(C=C[C@@H]4CC[C@H](C)CC(O)(O)C4)=C\C=C=C[C@@H](C2=CC1)[C@@H]1C(C)C=CC=C[C@@H]31	TargetDiff	5F2U	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72003	CC(CC(O)C(O)CN)Oc1ccc(-c2ccc(Cl)cc2)c(F)c1	TargetDiff	5F2U	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72004	C1COC2C(C1)CC1CCC3CCCC2C31.CCC1CCCCC2CC(C)(CN)C12	TargetDiff	5F2U	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72005	CCC1=CC(OC)C(NC2=NCC(C(C)O)C2Cl)=CC1OC	TargetDiff	5F2U	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72006	CCCC(NC1(O)C2C(F)=CCC=C2C2(O)CC1C(O)C(C(O)C1C=CCC(Cl)=C1O)O2)Oc1cc(C)cc(C)c1	TargetDiff	5F2U	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72007	CCCNCCC1=C(Nc2ccc(C)cc2)C2C(=Cc3nc(NCO)ccc3C2C)N=C1	TargetDiff	5F2U	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72008	CCCC=CC[C@H]1S[C@@H]2CC/C=C3/[C@H](C=C=CN4CC(CCC)=C5C=CC1C2[C@H]54)C[C@@H](C)[C@@H]1[C@H](C2OCOC[C@H]21)[C@H]3C(=O)O	TargetDiff	5F2U	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72009	Cc1ccccc1C(CCCCCCCC(C)C(C)CCCCCO)C(N)=O	TargetDiff	5F2U	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72010	CCCC(CC1C=CCCC1)CC(C)C1=C(O)C(C)CC1	TargetDiff	5F2U	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72011	CCNC(=O)CCO.O=C(O)CC(=NC(O)(F)F)N1C[C@H]2C[C@@H](O)CO[C@H]21	TargetDiff	5OHT	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72012	O=C1CC2C3C(O)C(O)C(O)C(O)C(O)(C3O)C2C(=O)O1	TargetDiff	5OHT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72013	OCC1C(O)C2C(O)C(O)C(O)COC2C1(O)O	TargetDiff	5OHT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72014	O=C(O)C1CCC(C(O)CO)OC1=O	TargetDiff	5OHT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72015	CCC1CCCC(C(=O)O)C(C(=O)O)C(O)OCCC(O)(CO)C(O)COC1=O	TargetDiff	5OHT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

72001 to 72015 of 73725 items. Total 4915 pages.