Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
8926	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4ccc(F)c(C(F)(F)F)c4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8927	COc1cccc(NC(=O)CCOc2cccc(-c3cccc(C(=O)c4ccc(C)cc4)c3)c2)c1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8928	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(C3CN(CC(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F)C3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8929	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(OCC3CCN(C4CCCCC4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8930	Cc1ccc(C(C)(C)S(=O)(=O)Nc2cccc(OCC(=O)Nc3cccc(Cl)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8931	Cc1ccc(C(=O)Cc2cccc(OCC(=O)Nc3cccc(N4CCN(S(=O)(=O)c5cccc(F)c5)CC4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8932	Cc1ccc(C2CCC(NC(=O)c3cc(C4CCCCC4)ncn3)C2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8933	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(OC(=O)Nc3ccc(C(F)(F)F)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8934	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4cccc(F)c4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8935	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(OCC(=O)Nc3ccc(C(F)(F)F)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8936	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4ccc(F)c(F)n4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8937	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4cccnc4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8938	Cc1ccc(C(=O)c2ccc(OCC3CCN(C4CCCCC4)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8939	Cc1ccc(C(=O)c2cccc(-c3cccc(C(F)(F)F)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8940	Cc1ccc(Oc2cc(NC(=O)c3cccc(C4CC4)c3)ccc2Cl)cc1	AlphaDrug	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

8926 to 8940 of 73725 items. Total 4915 pages.