Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
19741	COc1ccc(-c2cc(NCc3cc(C(=O)O)ccn3)n[nH]2)cc1	AlphaDrug	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19742	COc1ccc(S(N)(=O)=O)cc1	AlphaDrug	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19743	Cc1cc(Nc2cc(C(C)(N)O)ccn2)n[nH]1	AlphaDrug	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19744	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cc(NC3CCCC3)cc(C(=O)O)c2)cc1	AlphaDrug	4P6P	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19745	COc1ccc(-c2cc(NCc3cc(N)cc(C(=O)O)c3)cc(C(=O)O)c2)cc1	AlphaDrug	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19746	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)Nc3ccc(Oc4ccnc5ncccc45)cc3)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19747	CNS(=O)(=O)c1ccc(NNc2ncc(F)c(-c3ccc(OC(=O)Nc4ccccc4F)cc3)n2)cc1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19748	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)NC3CCC(NC(=O)C4CCCCC4)CC3)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19749	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)Nc3ccc(Oc4cc(N)ncn4)cc3)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19750	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)Nc3ccc(-c4cccc(S(N)(=O)=O)c4)c4ccccc34)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19751	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)Nc3ccc(-c4ccnc(C(F)(F)F)c4)c(F)c3)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19752	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)Nc3ccc(-c4ccc(C(F)(F)F)cc4)cc3)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19753	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)Nc3ccc(-c4ccc(C(=O)Nc5ccc(F)cc5)cc4)cc3)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19754	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)NC3CCCN(c4ccc(C(N)=O)cc4)CC3O)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19755	CC1(C)COCCN(c2ccc(NC(=O)Nc3ccc(-c4cc(C(F)(F)F)nc(N)n4)c4cccnc34)cc2)C1	AlphaDrug	5YFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

19741 to 19755 of 73725 items. Total 4915 pages.