Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
19711	CC(=O)N1CCC(c2cc(NC(=O)c3cc(C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F)ccc3C(F)(F)F)cc3[nH]ncc23)CC1	AlphaDrug	6P9E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19712	CC(=O)N1CCC(c2cc(NC(=O)c3cc(C)ccc3Oc3ccc(Cl)c(F)c3)no2)CC1	AlphaDrug	6P9E	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19713	CC(=O)N1CCC(c2cc(NC(=O)c3cc(C)c(C(F)(F)F)n4nc(-c5ccc(Cl)cc5)cc4c3=O)n[nH]2)CC1	AlphaDrug	6P9E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19714	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)N3CCCCC3CO)cn3cc(C4=CC=NC5=CCCC4N5)nc23)nn2ccnc12	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19715	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)N3CCCCC3CO)cn3cc(C4=CC=NC5=CCCC4N5)nc23)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19716	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)N3CCCCC3CO)cn3cc(C4=CC=NC5=CCCC4N5)nc23)cc(C(F)F)c1	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19717	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)N3CCCC3(C)O)cn3cc(C4=CC=NC5=CCCC4N5)nc23)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19718	CC1=N/c2cn3cc(C4=CC=NC5=CCCC4N5)nc3c(n2)N/C(C(F)(F)F)=C\C(C)=N\1	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19719	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)N3CCCCC3)cn3cc(C4=CC=NC5=CCCC4N5)nc23)ccn1	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19720	Cc1cnc(Nc2cc(-c3cnn4cc(-c5ccnc(NC(C)c6cccc(C(F)(F)F)c6)n5)cnc34)ccn2)cc1C	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19721	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NC3CCC3)cn3cc(C4=CC=NC5=CCCC4N5)nc23)c(Cl)n1C	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19722	Cc1cc(Nc2nc(C(F)(F)F)cn3c(-c4cnn(CC(F)F)c4)cnc23)cc(N2CCNCC2)n1	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19723	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)N3CCCCC3CO)cn3cc(C4=CC=NC5=CCCC4N5)nc23)cnn1	AlphaDrug	6EIQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19724	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cc(OCCC3CC3)cc(C(=O)O)c2)cc1	AlphaDrug	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19725	Cc1n[nH]c2ccc(S(N)(=O)=O)cc12	AlphaDrug	4P6P	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

19711 to 19725 of 73725 items. Total 4915 pages.