Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
19681	Cc1cc(N2CCN(C(=O)NC3CCCCCC3)CC2)cc(NS(=O)(=O)c2ccc(C(F)(F)F)cc2Cl)n1	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19682	CN(C)CC(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)NC(/C=C/c1ccc(O)cc1)CCCCCN=C(N)N	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19683	Cc1cc(N2C=COCC2)cc(NS(=O)(=O)c2ccc(C(F)(F)F)cc2)n1	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19684	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccc(-c4cncc(Cl)c4)cc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C=NC4=O	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19685	Cc1cncc(-c2ccc3c(c2)c2c4c(c5c6ccccc6n6c5c2n3C2CC(O)(CO)C6(C)O2)C(=O)N=C4)c1	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19686	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccc(CCCC(=O)Nc4ccc(F)cc4F)cc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19687	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccc(-c4cnco4)cc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19688	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccc(-c4cnc(N)nc4)cc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19689	Cc1cc(C(C)(C)C)cc2ncnc(NC(=O)c3ccc(-c4ccnc(Nc5ccc(C(F)(F)F)cc5)c4)cc3)c12	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19690	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccc(-c4ccccc4)cc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19691	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C=NC4=O	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19692	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccc(-c4cnccc4C(F)(F)F)cc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19693	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccc(-c4cnnn4CCCCc4ccccc4)cc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5UV2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19694	O=C1N=C(CCN2CCN(C(=O)C3CCCCC3)CC2)OC(CO)c2ccccc21	AlphaDrug	5G5V	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19695	OCC1CN(Cc2ccc(Nc3ccc(-c4ccccc4)cc3)nc2)CCO1	AlphaDrug	5G5V	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

19681 to 19695 of 73725 items. Total 4915 pages.