Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
19666	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCCC1)C(=O)NC1CCN(c2cccc(OC(F)(F)F)c2)CC1	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19667	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1ccc2ccccc2n1)C(=O)NC1CCCCCC1	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19668	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCc2ccccc21)C(=O)NC(C)(C)C	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19669	CC(C)CC(NC(=O)C(CC(=O)O)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)OC(C)(C)C)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(N)=O	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19670	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCCC1)C(=O)NC1CC(=O)NC1CCc1cccc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19671	CC(C)(C)c1ccc(-c2ccc(S(=O)(=O)N(c3ccc(O)cc3)c3ccc(Cl)cc3)cc2)cc1	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19672	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCC(C(N)=O)CC1)C(=O)NC1CCCCCC1	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19673	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCc2ccccc21)C(=O)NCc1cccc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19674	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1(c2cccc(O)c2)CCC1)C(=O)NCCCCc1ccccc1	AlphaDrug	5EF7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19675	CC1=C/C(N2CCC(N3CCCCC3)CC2)=C\C(NS(=O)(=O)c2ccc(C(C)(F)F)cc2)=c2\cccc\c2=N\1	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19676	Cc1cc(N2CCC(n3c(=O)n(C)c(=O)c4ccccc43)CC2)cc(NS(=O)(=O)c2ccc(C(F)(F)F)cc2)n1	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19677	CC1=C/C(N2CCC(C(=O)O)CC2)=C\C(NS(=O)(=O)c2ccc(F)cc2Cl)=c2\cccc\c2=N\1	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19678	Cc1cc(N2CCCC2C(=O)NC(C)C(N)=O)cc(NS(=O)(=O)c2ccc(Cl)cc2)n1	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19679	Cc1cc(N2C=CC(n3c(=O)n(CCN(C)C)c(=O)c4ccccc43)=CC2)cc(NS(=O)(=O)c2ccc(C(F)(F)F)cc2)n1	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19680	Cc1ccc(-c2ccc(S(=O)(=O)c3cc4cccc(Cl)c4[nH]c3=O)cc2)cc1	AlphaDrug	6NW3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

19666 to 19680 of 73725 items. Total 4915 pages.