Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
19936	COc1ccc(C2=C(c3ccc(-c4ccc(C(O)c5ccc(C6CCCC6)c(F)c5)o4)cc3)CCCC2)cc1C(N)=O	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19937	COc1ccc(C2=C(c3ccc(-c4ccc(C(O)c5ccc(C)c(C)c5)o4)cc3)CCCC2)cc1C(N)=O	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19938	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5cc(C6CCCC6)ccc5-c5ccc(F)cc5C)CCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CCCC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19939	COc1cccc(-c2cc(C3CCCC(=O)N3)cc(C(C)(O)c3ccc(C4CCCCC4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19940	COc1cccc(-c2cc(C(=O)O)cc(C(C)(O)c3ccc(C4CCCCC4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19941	COc1ccc(CC2CCCN(CC3(c4cc(C)cc(C)c4)CCCC3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19942	COc1ccc(CC2CCCN(CC3(c4ccccc4)CCCCC3)CC2)c2cc(C(=O)O)ccc12	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19943	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5ccc(C)c(O)c5)CCCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CCCC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19944	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5cc(C(=O)O)ccc5-c5ccc(F)cc5C)CCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CCCC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19945	COc1cccc(-c2cc(-c3ccc(C(=O)O)cc3)cc(C(C)(O)c3ccc(C4CCC4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19946	COc1cccc(-c2cc(C3=CCCCC3)cc(C(C)(O)c3ccc(C4CCC4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19947	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5cc(N)cc(C(=O)O)c5)CCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CCCCC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19948	CO/C1=C/N=C(/c2cccc(C(C)(O)c3cccc(OC)c3)c2)Nc2cc(C(=O)O)cc(c2)C2CC=C2c2ccccc21	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19949	COc1cccc(-c2cc(C3CCCN(C(=O)O)CC3)cc(C(C)(O)c3ccc(C4CCCCC4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19950	COc1cccc(-c2cc(C3=CC(O)CCC3)cc(C(C)(O)c3ccc(C4CCCCC4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

19936 to 19950 of 73725 items. Total 4915 pages.