Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
19966	COc1ccc(CC2CCCN(CC3(c4ccc(C)c5ccccc45)CCCCC3)CC2)cc1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19967	CO/C1=C\N=C(\c2cccc(C(O)(Cl)c3ccccc3)c2)Nc2cc(C(=O)O)cc(c2)C2CC=C2c2ccccc21	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19968	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5cc(C(=O)O)ccc5-c5ccc(F)cc5)CCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CC=CC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19969	COc1cccc(-c2cc(C3=NC(C4CCCCC4)CC3)cc(C(C)(O)c3ccc(C4CCCC4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19970	COc1cc(C2=NC(O)C=CC2c2ccc(C3CCCC3)cc2)ccc1C1=CC=CC1	AlphaDrug	1DXO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19971	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5cc(C(=O)O)cc(C(=O)O)c5)CCCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CC=CC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19972	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5cccc(C6CCCC6)c5)CCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CCCC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19973	COc1ccc(CC2CCN(CC3(c4ccc(C5CCCC5)cc4)CCCCC3)c3ccccc32)cc1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19974	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5cc(C(=O)O)ccc5C)C=CCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CCCC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19975	COc1ccc(CC2CCCN(CC3(c4ccc(F)cc4)CCCCC3)CC2)cc1-c1cc(C)c(C)c(C)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19976	COc1cccc(-c2cc(C3CCCCC3)cc(C(C)(O)c3ccc(C4CCCCCC4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19977	COc1cc(C2=NC(O)CN(c3ccc(C4(c5cc(C6CC6)ccc5-c5ccc(F)cc5C)CCCC4)cc3)C2)ccc1C1=CC=CC1	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19978	CO/C1=C/N=C(/c2cccc(C(C)(O)c3ccc(F)cc3)c2)Nc2cc(C(=O)O)cc(c2)C2CC=C2c2ccccc21	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19979	CO/C1=C/N=C(/c2ccc(O)c(CC3CCCC3)c2)Nc2cc(C(=O)O)cc(c2)C2CC=C2c2ccccc21	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
19980	COc1ccc(C2=C(c3ccc(-c4ccc(-c5cccc6ccccc56)o4)cc3)CCCC2)cc1C(N)=O	AlphaDrug	1DXO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

19966 to 19980 of 73725 items. Total 4915 pages.