Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
41956	O=C1NC(=O)c2cccc3cccc1c23	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41957	O=C1C=C(S(=O)(=O)N2CCC(=C3CCCCC3=O)C2)CC(c2[nH]c(=O)c3cccc4c3c2C(O)=CC4=O)=C1O	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41958	CC=C1C=C(S(=O)(=O)N2C=CC(C(=O)OC)=CC2)CC(c2[nH]c(=O)c3ccc4ccnc5c4c3c2CC5)=C1F	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41959	CC=C1C=C(c2[nH]c(=O)c3ccc(O)c4c3c2C(C)=CC4=O)CC(S(=O)(=O)NCc2cncnc2)=C1	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41960	CC=C1C=C(c2[nH]c(=O)c3cccc4c3c2C(O)=CC4=O)CC(S(=O)(=O)N2CCC(=C3C=CC=CC3)C2)=C1F	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41961	C=C1C=C(c2[nH]c(=O)c3cccc4c3c2C(O)=CC4=O)CC(S(=O)(=O)N2CCC(=C3C=CCC(=O)[C@@H]3C)C2)=C1	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41962	CC=Cc1cnc2cccc(C=Cc3cc(C)cc(-c4cc5c([nH]4)C(=O)N=C4C5=CCC[C@H]4C)c3O)c2c1	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41963	C=C1C=C(S(=O)(=O)N2CCC(=C(C=CC)CCCC)C2)CC(c2[nH]c(=O)c3cccc4c3c2C(O)=CC4=O)=C1O	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41964	CC=C1C=C(c2[nH]c(=O)c3cccc4c3c2C(O)=NC4=O)CC(S(=O)(=O)N2CCc3cccc(C)c3C2)=C1	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41965	Cc1ccc(O)cc1CC1Cc2cccc3c2C(C1)C1OC(CCc2ccccc2)CCN1C3=O	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41966	Cc1cc(CNS(=O)(=O)C2=C(F)CC3=C(C2)c2[nH]c(=O)c4cccc5c4c2C(=NC5=O)CC3)cs1	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41967	COC1C=CC(=C2CCN(S(=O)(=O)C3=C(F)CC4=C(C3)c3[nH]c(=O)c5cccc6c5c3C(=CC6=O)OC4)C2)C=C1	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41968	CC1=CC2=C([C@@H]3Cc4cccc5c4[C@H](C3)[C@H]3O[C@H]4CCC(=C6C=CSC6)C[C@@H](C4)N3C5=O)C(=O)C=C[C@H]2C=C1	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41969	CC1=CC(=O)c2cccc3c(=O)[nH]c(C4=CC(C)C=C(S(=O)(=O)N5CCc6cc(C)ccc6C5)C4)c1c23	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
41970	CC1C(F)=C(C2=C3C=C=CC4=C3C(CCC4=O)C(=O)N2)CC(S(=O)(=O)N2CCCC2)=C1F	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

41956 to 41970 of 73725 items. Total 4915 pages.