Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
42046	C1=NCCc2ccccc21	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42047	O=C1C=C(S(=O)(=O)N2CCC(=C3CCC=CC3=O)C2)CC(c2[nH]c(=O)c3cccc4c3c2C(O)=CC4=O)=C1O	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42048	CO[C@H]1CC(=C2C=C(C)C=CC2=O)C[C@H]1Oc1ccc(C)c(-c2cccc3ccccc23)c1	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42049	Cc1c(C2CC(C)c3nc(N)ccc3C2=O)[nH]c(=O)c2ccccc12	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42050	O=C1C=C2OCC3=C(CC(S(=O)(=O)N4CCC(=C5C=CC(O)C=C5)C4)=C(F)C3)c3[nH]c(=O)c4cccc1c4c32	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42051	O=C1C=C(c2[nH]c(=O)c3ccc4ccnc5c4c3c2CC5)CC(S(=O)(=O)NCc2ccc3ccccc3c2)=C1	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42052	O=C1C=CC2=C(c3cccc(OC4CCC(c5ccccc5O)=NC4)c3)C=NC2=C1	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42053	CC1=CC2=C([C@@H]3Cc4cccc5c4[C@H](C3)[C@H]3O[C@H]4CCC(=C6C=CSC6)C[C@@H](C4)N3C5=O)C(=O)C=C[C@@H]2CC1=O	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42054	CC1=C[C@@H](C)C2=NC(=O)c3[nH]c(-c4cc(C)cc(C=Cc5cccc6c5C=C(C)[C@@H]6C)c4O)cc3C2=C1	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42055	Cc1c(F)cc(O)cc1CC1Cc2cccc3c2C(C1)C1OC(CCc2ccsc2)CCN1C3=O	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42056	C=C1C=C(S(=O)(=O)N2CCC(=C3C=CC=CC3)C2)CC(c2[nH]c(=O)c3cccc4c3c2C(O)=CC4=O)=C1O	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42057	Cc1cc(CNS(=O)(=O)C2=CC(=O)C=C(c3[nH]c(=O)c4ccc(C)c5c4c3CCC5)C2)ccc1O	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42058	NC(=O)c1ccc2c(c1)OCN(S(=O)(=O)C1=CC(=O)C=C(c3[nH]c(=O)c4ccc5cccc6c5c4c3CC6)C1)C2	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42059	COC1=CC(=C2CCN(S(=O)(=O)C3=CCC(F)=C(c4[nH]c(=O)c5cccc6c5c4C(O)=CC6=O)C3)C2)C=CC1	Pocket2Mol	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
42060	Oc1ccc2c3c1-c1ccoc1CC3CNO2	Pocket2Mol	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

42046 to 42060 of 73725 items. Total 4915 pages.