Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
4366	COc1cc(-c2cncc(C(=O)O)c2)ccc1Cc1nc2cc(-c3ccc(N4CCCC4)cc3)ccc2c(=O)[nH]1	AlphaDrug	6I64	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4367	COc1cc(C(=O)Nc2cc(N3CCN(C(=O)NC4CCCCC4)CC3)ccc2C)ccc1Cc1ccccc1	AlphaDrug	6I64	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4368	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCCN(C(=O)c3cccc(OCC(=O)O)c3)CC2)cc1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4369	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(NC(=O)c3ccc4c(ccn4C)c3)CC2)cc1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4370	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(NC(=O)CC(C)(C)NC(=O)c3ccc4c(ccn4C)c3)CC2)cc1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4371	CC(=O)CC1CCC(C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC2CCN(S(=O)(=O)c3ccc(C(C)C)cc3)CC2)N1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4372	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(NC(=O)c3cccc(C(C)(C)C)c3)CC2)cc1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4373	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(NC(=O)c3ccc(-c4cccc5ccccc45)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4374	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(=Cc3ccc(C(N)=O)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4375	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(NC(CC(=O)O)c3ccc(Cl)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4376	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCN(C(C)(C)c3cccc(OC4CCCCCC4)c3)CC2)cc1	AlphaDrug	4YXI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4377	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCC(O)CN1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4378	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCCN1C(=O)CO	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4379	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(Nc3cccc4c3OCCCO4)CC2)cc1OC	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4380	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1C=CCC(O)CN1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

4366 to 4380 of 73725 items. Total 4915 pages.