Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
4381	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CC=CCCC1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4382	C=C(C(=O)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)OC)c1cccc(NS(=O)(=O)c2cccc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4383	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)Cc1csc2ccccc12	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4384	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccn[nH]1)NC(=O)C1CCCCN1C(=O)CO	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4385	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)NC1CCCCCN(C(=O)C2CCCCC2)C1=O	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4386	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCC(C)OC1=O	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4387	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1cccc(O)c1)NC(=O)C(=O)C1CCc2ccccc21	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4388	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)NC1CCCCN(C)CCC1O	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4389	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1/C=C\C(O)CC(O)CN1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4390	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCC(N)C1=O	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4391	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCC(=O)N1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4392	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)Cc1cccnc1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4393	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ncc[nH]1)NC(=O)C1C=CCCC1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4394	C=C(NC1C/C=C\CCCCCC(=O)NC(=O)NC(Cc2ccc(O)cc2)C1)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)OC	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4395	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCN(C(C)C(=O)N(C)C)C1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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