Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
4441	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCN(C(=O)C2CC2)C1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4442	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCC(N)C(O)CN1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4443	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NC4CCCCC4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4444	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1cccc(NS(=O)(=O)c2ccccc2)c1)C(=O)NC1CCCCC1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4445	COC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(C)(C)NS(=O)(=O)Cc1ccccc1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4446	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1C=CCC(C)(C)CC1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4447	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCN(C(=O)C(N)=O)C1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4448	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCN(C2CCCC2)C1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4449	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)Nc1cc(C2CCCCC2)ccc1C(=O)O	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4450	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCC1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4451	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCC(O)CN1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4452	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1NCC(O)CCC(C)C1Cc1ccc(O)cc1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4453	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1cccc(O)c1)C(=O)NO	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4454	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)Cc1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4455	COC(=O)C(Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCCN(C)CC1	AlphaDrug	2E6D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

4441 to 4455 of 73725 items. Total 4915 pages.