Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
4546	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3C=CN(c4ccc(C(=O)NN5CCCCCC5)cc4C)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4547	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3C=CN(c4ccc(C(F)(F)F)cc4C(F)(F)F)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4548	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3CCN(c4ccc(N5CCOCC5)nc4)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4549	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3CCN(c4ccc(C(=O)NC5CCC(N)C5)cc4C(F)(F)F)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4550	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3CCN(c4ccc(Cl)c(Cl)c4)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4551	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)c3ccc(OCCCO)cc3O)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4552	Cc1ccnc(-c2cccc(NC(=O)c3cc(C4CCCC4)nc(N4CCCC4)n3)c2)n1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4553	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3CCN(c4ccc(-c5nc(C6CC6)n[nH]5)cc4)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4554	Cc1cccc(C2=C(C(=O)N3CCCC3CO)CCC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4555	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3CCN(c4ccc(C(=O)NCCCCCC(=O)O)cc4C(F)(F)F)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4556	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3CCN(C(=O)N4CCCCC4)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4557	Cc1ccccc1-c1nc(-c2ccc(OCC(=O)O)c3ccccc23)nc(C2CCN(C(=O)c3cccc(C(F)(F)F)c3)CC2)n1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4558	Cc1ccnc(-c2ccc(C3CCN(C(=O)N4CCCC4C(=O)NC4CCCCCCCC(=O)N5CCCC5C4)CC3)cc2)n1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4559	Cc1cccc(C2C=CN(C(=O)C3CCN(c4ccc(C(=O)N5CCCCC5)cc4C(F)(F)F)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4560	Cc1cccc(C2CCN(C(=O)C3CCN(c4ccc(OCCCC(F)(F)F)c(N)c4)CC3)CC2)c1	AlphaDrug	3O96	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

4546 to 4560 of 73725 items. Total 4915 pages.