Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
4801	COc1cc(C2=NCC(C)(O)C2)ccc1NC(=O)NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccccc2)cc1	AlphaDrug	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4802	COc1cc(C2=CCN(C3CCCC3)C=C2)ccc1NC(=O)NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccccc2)cc1	AlphaDrug	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4803	COc1cc(C2=CCCCC2)ccc1NC(=O)NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccccc2)cc1	AlphaDrug	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4804	COc1cc(C2=NCCCCC2)ccc1NC(=O)NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccccc2)cc1	AlphaDrug	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4805	COc1ccc(Cc2ccccc2-c2ccc(S(=O)(=O)NC(=O)Nc3ccc(C(=O)O)cc3OC)cc2)cc1	AlphaDrug	5I0B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4806	COc1ccc([SH](=O)(Nc2cc(C(F)(F)F)cc(C(F)(F)F)c2)c2cccc3ccccc23)cc1	AlphaDrug	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4807	COc1cc(-c2cc(F)ccc2C)ccc1NC(=O)NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccccc2CCCC(=O)NO)cc1	AlphaDrug	5I0B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4808	COc1cccc(Nc2nc3cc(-c4ccc(CNC(=O)NC5CC5)cc4)ccc3[nH]2)c1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4809	COc1cccc(Nc2nc3cc(-c4cc(N)cc(C(F)(F)F)c4)ccc3o2)c1CN1CCN(C(C)(C)C)CC1	AlphaDrug	5FSN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4810	COc1cccc(Nc2nc3cc(-c4cc(OC(C)C(F)(F)F)ccc4OC(F)(F)F)ccc3o2)c1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4811	COc1cccc(Nc2nc3cc(C(C)(C)C)ccc3o2)c1OCC1CCN(C(=O)NCC(C)(C)C(=O)O)CC1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4812	COc1cccc(Nc2nc3cc(-c4cnn(C5CC5)c4)ccc3n2C2CC2)c1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4813	COc1cc(O)ccc1NC(=O)c1c(N)n2ncc(CC(O)C3CC3)c2n1Cc1ccc(C(F)(F)F)cc1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4814	COc1cccc(CNC(=O)c2ccc3c(-c4ncc(Cl)cn4)[nH]c(-c4ccc(Cl)cc4)c3c2)c1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4815	COc1cccc(Nc2nc3cc(-c4cc(N)cc(C(F)(F)F)c4)ccc3o2)c1CN1CCN(C(=O)NC(C)C(=O)O)CC1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

4801 to 4815 of 73725 items. Total 4915 pages.