Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
4816	COc1cccc(Nc2nc3cc(-c4ccc(CNCC(=O)O)cc4)ccc3o2)c1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4817	COc1cccc(Nc2nc3c(C4(C(=O)O)CC=CCC4)cccc3[nH]2)c1	AlphaDrug	5FSN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4818	CCC(=O)N1CCN(c2ccc(C(=O)Nc3cnc(N)c(C(=O)Nc4cc(O)cc(-c5ccc(OC)cc5)c4)c3)cc2)CC1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4819	COc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3cc(NC(=O)c4ccc(N5CCN(C(C)(C)C)CC5)cc4)cnc3N)ccc2C(F)(F)F)cc1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4820	COc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3cc(NC(=O)c4ccc(N5CCNCC5)cc4)cnc3Cl)cc(OCC(=O)O)c2)cc1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4821	COc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3cc(NC(=O)c4ccc(N5CCN(C(C)(C)C)CC5)cc4Cl)cnc3C)ccc2Cl)cc1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4822	COc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3cc(NC(=O)c4ccc(N5CCN(C(C)(C)C)CC5)cc4)cnc3N)cc(O)c2C(F)(F)F)cc1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4823	COc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3cc(NC(=O)c4ccc(N5CCN(C(C)(C)C)CC5)cc4)cnc3N)cnc2OCC(=O)O)cc1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4824	COc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3cc(NC(=O)c4ccc(N5CCN(C(C)(C)C)CC5)cc4)cnc3N)ccc2F)cc1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4825	COc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3cc(NC(=O)c4ccc(N5CCN(C(C)=O)CC5)cc4)cnc3C)ccn2)cc1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4826	COc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3cc(NC(=O)c4ccc(N5C=CN(C(C)(C)C)CC5)cc4)cnc3N)ccc2C(=O)O)cc1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4827	CNC(=O)N1CCN(c2ccc(C(=O)Nc3cnc(N)c(C(=O)Nc4cc(OCC(=O)O)cc(-c5ccc(OC)cc5)c4)c3)cc2)CC1	AlphaDrug	4YNL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4828	CC(C)N(C)C(=O)c1cc(-c2cc(C(=O)c3ccc(OCC4CC4)c(Cl)c3)ccc2Cl)on1	AlphaDrug	4QY3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4829	CC(C)N(C)C(=O)c1cc(-c2cc(-c3ccc4c(c3)CCCC4)ccc2C(=O)NO)ccc1O	AlphaDrug	4QY3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
4830	Cc1ccc(C(=O)OC(C)(C)C)cc1-c1ccc(O)c(C(=O)N(C)C(C)C)c1	AlphaDrug	4QY3	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

4816 to 4830 of 73725 items. Total 4915 pages.