Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
65521	CCC1C=C2C(=NC3C2OC2C=C(F)CC=C2On2cnc4c(c2=O)C(NCOC4)C2C3C(O)CC(O)(O)C2O)C=CC1	TargetDiff	4CWS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65522	CC(=O)Oc1oc2ccccc2c1C(ONc1ccc(O)cn1)C(C)O	TargetDiff	4CWS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65523	CC(=O)OC1=C2C(CC1)C(=O)C1=C(CC(C)N1C)N2C1C=CC=CC1C1=CCC2C=CC=CC2=C1	TargetDiff	4CWS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65524	CC(=O)OC1CN(S(C)=O)C2CCC(C2)C2=CC3NCc4cccc(c43)C2=C=Cc2ccc(O)c(c2)Nc2cc1c1c(n2)CCN1	TargetDiff	4CWS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65525	CC1=NNC(=O)N(C2CC(OC(=O)CC(O)CO)O2)C(c2cnc3cc(O)ccc3c2)=C1	TargetDiff	4CWS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65526	C[C@@H]1CN(c2ccccc2)NC2=C3C=CCC=C3[C@@H](S)C(=CCN(C)C)[C@@H](C(=O)O)[C@H]21	TargetDiff	4CWS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65527	Cc1ccc(C(=O)NC2C3C=CC=CC3C3CCC4C(=O)CCC2(O)C43)c(O)c1Cl	TargetDiff	4CWS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65528	CN1Cc2ccc(F)cc2CC(C2C(NC3=CNC=CC3Cl)CC(=O)C2(C)O)O1	TargetDiff	4CWS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65529	CON1CNc2cccc(N=C[C@@H]3CCN=C4N=C(C)N=CC43)c21	TargetDiff	4CWS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65530	CCOCCC1CCC2(CC1)C(O)CCC2C(=O)O.Cc1cccc(N)c1	TargetDiff	5CS3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
65531	C1COCN1.CCCCC(OCC(=O)O)C1CCCN1.N=C1CCCN1	TargetDiff	5CS3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
65532	CC(=O)N1CCC(c2cc(CO)nc(CCCF)c2)C1.Cc1ccccc1	TargetDiff	5CS3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
65533	CC(C)(O)O.CCCCCCCCC.FC(F)C(F)F	TargetDiff	5CS3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
65534	CC1CCC2=CCN=CN21.CCCOCc1ccccc1.NCc1ccccc1	TargetDiff	5CS3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
65535	CCNC(CSCC(=O)O)OCC	TargetDiff	5CS3	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

65521 to 65535 of 73725 items. Total 4915 pages.