Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
65491	CCN(CCCC(C)(C)CCC1(O)CCCCC(C)C(C)C1)CCC(C)C(C)C(C)C(=O)O	TargetDiff	4BEL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65492	CCCCCN1CCC2=C3CC(C)(CC2=O)C(CC)C(O)C(=O)NCC(O)C2C=CC=CC(=C2)CN3C1	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65493	CC1C(O)C(C2C3CCCC4=C3C(CC(O)C4)C2CO)C(O)C1C(=O)O	TargetDiff	4JXS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65494	[O]N([O])c1ccc(C(O)CC(NC2CNNC2=O)C(O)C(=O)O)cc1	TargetDiff	4JXS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65495	CC(=O)CCCC(O)C(NC(C(C)C1CC2(O)C(O)C(O)C(C)(C)N2C(=O)O1)C(C)(O)O)C(=O)O	TargetDiff	4JXS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65496	CCC(=O)C1CCOC(=S)/C=C2/C=CC(OC)C=C3CC4CC(O)(OC4C32)C1C	TargetDiff	4JXS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65497	O=C(O)NC1CCC(CC(O)CO)C(O)C1	TargetDiff	4JXS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65498	CC(=O)N1C2OC(=O)CC(C)C2CC(c2ccccc2)C1C(=O)NC(N)=O	TargetDiff	4JXS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65499	CC(=O)ON(C1CCCO1)C1CC2CC(CO)CC2C1(O)O	TargetDiff	4JXS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65500	CC(CC(O)C(CC(C(O)CF)C(O)C1(O)CCCCCC1C)C(=O)O)C(=O)O	TargetDiff	4JXS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65501	N=C1N=CCC(N2C(=O)OCC2C(OP(=O)(O)O)C(=O)O)=N1	TargetDiff	4JXS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65502	O=C(CO)NC(O)(CC(O)C1CCC2C(CCC2(O)O)C1)C1Cc2ccccc2O1	TargetDiff	4JXS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65503	CC1=CC2=C3C(C(=O)C4=CC(C)=NC(=O)C4)=CC=C4NC(C)OC(C)C(O)(C2=CC=C1)N43	TargetDiff	5IVC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65504	O=C(O)C1CCN2C(=O)C3=C(CC=CC=C3)C12	TargetDiff	5IVC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65505	C=C1C(=O)C(C)=C(O)C1=O	TargetDiff	5IVC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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