Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
65461	CCC1=CC=CC2C(C(N)C(O)CC(C)O)CC3(C(O)CO)C4CC(=O)OC=C4C3C12	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65462	CCC1CCCCC(N)CC(C)C(=O)N(C)C(=O)C2C=C3CCC(O)CCCN3C(CC1)C2	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65463	CCCCCCCCC(C)C1CC2C(C)CC(O)C2C2N=C(NC)CNCC12	TargetDiff	4BEL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65464	CC(C)N1CC2CCC1CCOC1CNC3=Cc4ccccc4C4OC(=O)N(C5C=CC(OC2)C(NC=O)=CC5O)C1C34	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65465	CC(C)CCCN1C=C=C(CO)C2C(C)N(CC3CCCC3)C3N(C)CC(C(C(O)C(C)C4C(C)CCC4C)C1=O)N23	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65466	CC(F)CC(Cl)C1=CC=CC2C(C=O)CC(P(=O)(O)O)C3C=C4C=CCC=C4N=C3C12	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65467	COC1NC(CCC(C)=C=Cc2ccccc2O)CC2C(=N)NC=CC12	TargetDiff	4BEL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65468	CC(O)C(O)CC1CC2OCC2C(C)(O)C(C)(C(O)CO)COC(O)(C(O)C(C)(O)CC2CCC3CCCCC32)CC(=O)O1	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65469	CC1OC(=O)C2C3C(NCCC3(N)O)C(O)C(O)C2C(O)(O)C2CC(=O)OC2CC2CCC3CCC1C32	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65470	CC1=CCC=C2NC(CC3CCCCCC3)CC(CCCP(=O)(O)O)COC12	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65471	CC(C)CCC(O)CCN(CCCC(C)N)C(=O)CNC(=O)C1CC(C)N(CC(C)N)C1C	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65472	CCCCN=CCc1cccc(CNC(=N)c2ccccc2)c1	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65473	CCCC(O)C12CCC(NC1)C(O)C(O)C(O)CS(O)(OC)C1CCC(CC1)C1COC(=O)CCC(CC1(O)O)C(O)C(CC)C2	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65474	CCCCOC1NN(C2CCCC2C)C2=C1CNC(=O)C1c3ccccc3C(N)C1C2	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65475	CNCNC1C(O)CC12CC(C)(C1CC3CC1C1CC3(C)CCC(O)C3CCC(C)C(C3)OC3CC(O)C(O)C3C1O)CO2	TargetDiff	4BEL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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