Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
66796	C=[SH]N1O[SH](OSP)CPPP1P	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66797	CC(O)C(OC1OCOC2C(O)C(O)C(CO)OC12)C(O)CO	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66798	O=C(O)C1CC(O)C(O)C2OC(O)(CO)CC12O	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66799	O=C(O)C(O)OC1C(O)CC(O)(O)C(O)C(=O)OC(CO)C1O	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66800	O=C(C(OO)OC1C(O)C(O)C(O)C1C1CCCO1)N1CCCC(O)C(O)C1	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66801	CS(CP(=O)(CCN)SP)(ON)PF	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66802	NC(C(=O)O)C1CCC(O)C2c3cncnc3C(O)C(O)C2N1	TargetDiff	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66803	NC(N)(O)CCOC1CC(O)CC(O)C(O)C1O	TargetDiff	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66804	O=C(O)C1CC(O)C(CC(O)CO)CO1	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66805	CCN1C(=O)C(O)CC(O)(C(O)CC(O)CO)C(O)(CO)C1=O	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66806	CC(COCC(C)C1CCCC(C)C1C(=O)O)C(O)C(O)CO	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66807	CC1(C2C(OC(CO)C(O)C(=O)O)OC2C(=O)O)C=CNC=N1	TargetDiff	1DJY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66808	O=C(O)CN1CC2CCCC(C(=O)O)C2C1	TargetDiff	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66809	O=C(O)C1CC(O)C(C2CC(O)CO2)CC1O	TargetDiff	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66810	CC1C(=O)C2C(O)CC(OC(CC3C=CCC=C3)CP(O)(O)(O)O)C2CN1C	TargetDiff	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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