Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69286	COC(=O)C1=CC(C2=CCC(=N)N=C2)CCC=C1	TargetDiff	4CWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69287	CC1CCC(C2CCC3/C2=[C]/C2=C=C(/N=C4/NCC5=NC(=O)C6=C(CN54)C3CCCC6)NNCC2)N1	TargetDiff	4CWR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69288	N=C1NC2=NC=NC3CCN(C4=C1C=c1ccccc1=CC4)C23	TargetDiff	4CWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69289	CCC1C(=O)C2NC=C=CC3=CC(=NC3)C3ON(C4=C(C)C(C)C(OC)=CC=C43)C1O2	TargetDiff	4CWR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69290	CC1=CC2CCC3=C(C)Cc4c3c(cc(=O)n4O)CCC2C(CO)C=C1O	TargetDiff	4CWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69291	CC(=O)[C@@H]1CN[C@@H]2C(=N)C(O)=C(C(=O)c3ccc(N=CO)c(N=O)c3)C=C12	TargetDiff	4CWR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69292	COC1=NNC(=O)C2C=CC(c3ccccc3)=CC2=N1	TargetDiff	4NUC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69293	CNC1C=C(OC)C=CC(C)C1=O	TargetDiff	4NUC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69294	C[C@H]1OC[C@@H]2CC3=C4CC(=CC(N)=O)[C@@H]5CO[C@@H]6C[C@H](O)C[C@@]7(C)C[C@H](C4=C5[C@@H]67)[C@@H]3[C@@H](C)[C@H]21	TargetDiff	4NUC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69295	COC1C(C2CCCS2)/N=C2\C=CCN(C2)C2=NN=CC=CC2NC/C=C\C=C\N1C	TargetDiff	4NUC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69296	CC1=C(C)C2C(CCC(F)(F)NC3CC(O)CCC32)C1=N	TargetDiff	4NUC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69297	O=C1CCN=C2c3cc4c(c5c3N=C(CCCC3C(=O)CC(O)CN53)C12)NCC4	TargetDiff	4NUC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69298	CCC1=C2C(=O)NCC2=CC=NC1	TargetDiff	4NUC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69299	N=C(C1=C2C=CCC=C2CN1)C(N)CO	TargetDiff	4NUC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69300	O=C(O)c1cc(C2OCCC2O)ccc1O	TargetDiff	4NUC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

69286 to 69300 of 73725 items. Total 4915 pages.